Молекулярно-генетическая характеристика заболеваний
Маннозидоз, альфа B, ¦50-100 случаев¦ ¦Kaneda et al.,1987 ¦
лизосомальный, ¦Лизосомальная ¦ ¦ ¦
248500; 19p13.2-q12;¦альфа-D-манно-¦ ¦ ¦
MANB.; ¦зидаза B ¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Маннозидоз, бета, ¦Очень редко ¦ ¦Lundin,1987 ¦
¦Лизосомальная ¦ ¦ ¦
248510; chr.4?; ¦бета маннози- ¦ ¦ ¦
MANB1.; ¦даза ¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
MASA синдром (сложная¦Редко ¦ ¦Schrander-Stumpel ¦
спастическая парапле-¦ ¦ ¦et al.,1990 ¦ ¦
гия), 303350; Xq28; ¦Маннозосвязыва¦ ¦Rosenthal et al.,1992 ¦
MASA.; ¦ющий лектин248¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз 1; ¦1:100 000, ¦Нонсенс -4; миссенс -3;¦Scott et al.,1991 ¦
Гурлера синдром;Шейе,¦1:600 000-Шейе¦сплайс. -1; дел. 1н. -1¦Scott et al.,1992 ¦
252800; 4p16.3; ¦Альфа-L-идуро-¦Мажорные: W402X (31%), ¦Moskowitz et al.,1993 ¦
IDUA.9; 19 кб, 14экз.¦нидаза 653¦Q70X (15%), P533R (3%) ¦Scott et al.,1993 ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз II;¦1:70 000 в Из-¦20% -крупные делеции,из¦Wilson et al.,1990 ¦
Хантера синдром, ¦раиле ¦них 4,5 % -всего гена; ¦Bunge et al.,1993 ¦
309900; Xq28; ¦Идуронат-2- ¦делеции 1-3н-7;миссенс-¦Flomen et al.,1993 ¦
IDS.29; 24 кб, 9 экз.¦сульфатаза 550¦13;нонсенс -4;сплайс.-5¦Hopwood et al.,1993 ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз ¦1 : 24 000 в ¦ ¦Kresse et al.,1971 ¦
IIIA,Санфилиппо синд-¦Нидерландах ¦ ¦ ¦
ром A, 252900; ¦(все типы A-D)¦ ¦ ¦
¦ ¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз ¦Наиболее часто¦ ¦Pande et al.,1992 ¦
IIIB,Санфилиппо синд-¦на юге Европы ¦ ¦ ¦
ром B, 252920;Chr.17?¦ ¦ ¦ ¦
¦ ¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз III¦Редко ¦ ¦Zaremba et al.,1992 ¦
C, Санфилиппо синдром¦ ¦ ¦ ¦
C, 252930;Chr.14 или ¦ ¦ ¦ ¦
21?; ¦ ¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз III¦Редко ¦ ¦Robertson et al.,1988a ¦
Санфилиппо синдром D,¦N-ацитил-глюко¦ ¦Robertson et al.,1988b ¦
252940; 12q14; ¦зоамин-6-суль ¦ ¦ ¦
GNS.; ¦фатаза 552¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз IYA¦1 : 300 000 ¦Миссенс - 3: N204K, ¦Tomatsu et al.,1991 ¦
Моркио синдром, ¦ ¦A138V, R386C; ¦Tomatsu et al.,1992 ¦
253000; 16q24.3; ¦Галактозамин-6¦делеция 2 н. - 1 ¦Masuno et al.,1993 ¦
GALNS.4; ¦сульфатаза 522¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз YI;¦Редко ¦Миссенс - 4: C137V, ¦Litjens et al., 1989 ¦
Марото-Лами синдром, ¦ ¦C117R, L236P, C405Y; ¦Schuchman et al.,1990 ¦
253200; 5q11-q13; ¦Арилсульфатаза¦делеция 1н. - 1 ¦Jin et al.,1992 ¦
ARSB.5; ¦B 533¦ ¦Litjens et al., 1992 ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Мукополисахаридоз YII¦Очень редко ¦Миссенс - 5: A619V, ¦Guise et al.,1985 ¦
Слая синдром, ¦ ¦R382C, R216W, R354W, ¦Oshima et al., 1987 ¦
253220, 7q21.11; ¦Бета-глюкуро- ¦R611W ¦Miller et al.,1990 ¦
GUSB.5; 21 кб, 12экз.¦нидаза 651¦ ¦Tomatsu et al.,1991 ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Сиалидоз типы I и II;¦50-100 случаев¦ ¦Oohira et al.,1986 ¦
липомукополисахаридоз¦ ¦ ¦Klein et al.,1986 ¦
256550; 6p21.3; ¦Нейраминида- ¦ ¦Sasagasako et al.,1993 ¦
NEU.; ¦за-1 ¦ ¦ ¦
---------------------+--------------+-----------------------+------------------------+
Фукозидоз, ¦30-60 случаев ¦Нонсенс - 5:Q351X-мажор¦Fowler et al.,1986 ¦
¦Фукозидаза аль¦ная (20%), E375X, Q77X,¦Kretz et al.,1992 ¦
230000; 1p34; ¦фа-L-1,ткане- ¦W382X, Y211X;делеции -4¦Roychoudhuri et al.,1988¦
FUCA1.10; 23 кб, 8экз¦вая 461¦(экз2-1,1н-3);сплайс.-1¦Seo et al.,1993 ¦
---------------------+--------------+-----------------------+-------------------------
1) - через ";" указаны различные наименования болезней либо аллельные варианты
2) - после наименования гена через "." указано количество идентифицированных мутантных аллелей к июлю 1994г.
3) - размеры генов указаны в килобазах (кб), иногда вместо размеров гена указаны размеры кДНК или мРНК
4) - размеры белка указаны в правом нижнем углу
5) - при количестве мутаций, меньшем 5, все они указываются после знака ":", при большем количестве перечисляются только типы мутаций
96) - частоты заимствованы из сводной таблицы Scriver et al., 189.Сокращения - взр.- взрослые; дел.- делеция; дупл.- дупликация; инс. - инсерция; н.- нуклеотиды; сплайс. замена нуклеотидов в донорном или акцепторном сайтах сплайсинга или мутации в интронных областях, создающие новый сайт сплайсинга; экз.экзон
Из таблицы 10.1 следует, что для 29 из 31 лизосомных болезней определена хромосомная локализация гена, причем в 26 случаях - абсолютно однозначно. 23 лизосомных гена клонированы. Для 20 лизосомных заболеваний описаны различные мутантные аллели, что подтверждает правильность идентификация соответствующих генов . Для 12 заболеваний найены мажорные мутации в различных популяциях. Для 8 заболеваний общее количество идентифицированных мутаций пока не превысило шести и, возможно, мажорные мутации для них еще будут идентифицированы.
Спектр мутаций в разных лизосомных генах очень разнообразен. Так, при болезни Фабри наряду с явным преобладанием миссенс мутаций обнаружено 14 внутригенных перестроек размерами от 0.4 до 8 кб, многие из которых имеют точки разрыва в экзоне 2 - области локализации большого числа Alu-повторов.Сам ген GLA содержит 12 различных Alu-элементов, составляющих около 30% его длины. В местах разрывов часто обнаруживаются короткие прямые и обращенные 2-6 нуклеотидные повторы.Одним из возможных механизмов возникновения структурных перестроек в данном гене может быть незаконная Alu-Alu рекомбинация или, что более вероятно, рекомбинация между короткими повторами. Участие Alu-элементов предполагается также при возникновении 16-кб делеции промоторной области и первых 5-и экзонов гена HEXB - мажорной мутации при болезни Зандхоффа. Нарушение процесса рекомбинации является, по-видимому, причиной возникновения очень большого числа крупных и мелких делеций в IDS-гене при синдроме Хантера. Высокая концентра-ция CpG динуклеотидов рассматривается как возможный эндогенный механизм возникновения мажорной среди евреев-ашкенази мутации P330FS в гене SPDM1 при болезни Ниманна-Пика типа B,так как эта делеция возникает в районе, где из 10 остатков 9 составляют цистеины.