Высокогорные луга Баргузинского хребта подразделяются на луга субальпийские, альпийские и нивальные. Первые из них широко распространены в парковых лесах, особенно в березняках вблизи верхней границы лесного пояса. Наиболее распространены мезофитные разнотравные и злаково-осоко-вые разнотравные луга. Среди самых характерных растений — дудник скальный, астрагал холодный, соссюрея широколистная, скерда сибирская. По берегам рек и ключей встречаются высокотравные луга с бодяком разнолистным, вейни-ком Лангсдорфа, соссюреей широколистной, чемерицей Ло-беля, дороникумом алтайским, геранью белоцветковой. В более сухих местах преобладают злаки и водосборы. На выпуклых участках появляются бадан, черника, и намечается переход к пустошам.

Альпийские луга занимают склоны гор выше границы леса- Они имеют низкий разнотравно-злаковый или разно-травно-осоково-злаковый покров с очень красочными сезонными аспектами. Злаки и осоки создают в нижнем их ярусе плотную дернину. Для этих лугов характерны володушка трехлучевая, змееголовник поникший, толстореберник альпийский, мытники Эдера и прелестный, мелколепестник повислый, горечавка крупноцветковая.

Нивальные луговины встречаются в тех местах, где долго сохраняются мощные снежники на мелкоземистом грунте. По составу травостоя нивальные луговины близки к альпийским лугам. Видовой состав их непостоянен. Здесь растут бадан, мятлик альпийский, водосбор железистый, иван-чай широколистный, фиалки алтайская и двухцветковая, мытник прелестный, астра альпийская, ожика камчадальская, родио-ла розовая. Нивальные луговины в течение всего лета освобождаются от снега, поэтому на них всегда можно встретить растения в разных фазах развития. Например, осенью у нижнего края луговины можно видеть увядающие растения с плодами, а у верхнего, недавно оттаявшего — молодые побеги пробудившихся трав.

В верхних поясах Баргузинского хребта широко распространены своеобразные растительные сообщества, называемые пустошами, которые существуют в условиях дефицита влаги. Часто встречаются чернично-бадановые пустоши, тесно связанные с маломощными, быстростаиваюшими снежниками. Кроме преобладающих черники и бадана, здесь обильны овсяница овечья, душистый колосок, водосбор железистый, ветреница сибирская. Среди прочих видов — герань белоцветковая, горечавка алтайская, толстореберник альпийский, володушка трехлучевая, горец байкальский, змееголовник крупноцветковый. Лишайниково-моховой покров не сплошной. При достаточном увлажнении встречаются разнотравные пустоши без участия черники и бадана. Фоновым видом в таких случаях обычно бывает ветреница сибирская. Изредка встречаются пустоши с массовым развитием фиалки алтайской и горечавки крупноцветковой.

На северном и южном плоскогорьях Баргузинского хребта развита растительность типа горных тундр. Сырые моховые тундры представлены разрозненно и фрагментарно. Шире распространены типчаково-лишайниковые горные тундры, свойственные средней части хребта. Они развиты на террасоподобных уступах склонов, а также на приподнятых участках дна долины, как правило, на склонах южной экспозиции. Почва здесь мелкоземистая, но сильно скелетная. Увлажнение достаточно обильно в первой половине лета, но после стаивания снега влаги не хватает. Плотный дерновой покров образуют овсяница овечья и лишайники кладина звездчатая, стереокаулон голый. В травяном покрове участвуют также ветреница сибирская, душистый колосок, плаун альпийский, фиалка алтайская, толстореберник, бадан.

Фауна

Фауна Баргузинскоко заповедника в целом типично таежная, но с некоторыми специфическими особенностями, обусловленными горным рельефом и непосредственной близостью Байкала.

Из 41 вида млекопитающих более 80% составляют типичные лесные обитатели. В большинстве своем это палеарктические, европейско-сибирские и транспалеарктические виды. Есть среди них такие таежные животные, как белка, летяга, средняя и крошечная бурозубки, широко распространенные на севере Европы, и в Азии. Встречаются и восточнопалеарктические виды: кабарга, соболь, колонок, азиатская лесная мышь, бурундук, лесной лемминг. Из палеарктических видов — представителей широколиственных лесов — характерны только благородный олень (изюбрь) и косуля (заходы), из центральноазиатских степных — солонгой, из центральноазиатских горнотундровых — алтайская (альпийская) пищуха и большеухая полевка. Весьма значительна доля голарктических видов; волк, лисица, ласка, горностай, росомаха, заяц-беляк, рысь, бурый медведь, лось, красная полевка и полевка-экономка. Имеются и представители берингийской фауны: чер-ношапочный сурок и северный олень. В Байкале обитает эн-демичная байкальская нерпа, предки которой жили в северных морях.

Список птиц заповедника насчитывает 265 видов. Среди гнездящихся преобладают виды с ареалами сибирского типа фауны: каменный глухарь, рябчик, глухая кукушка, уральская и бородатая неясыти, мохноногий и воробьиный сычи, ястребиная сова, желна, кукша, кедровка, снегирь, щур, обыкновенный и белокрылый клесты, сибирская чечевица, белошапочная и желтобровая овсянки, свиристель, малая, сибирская и таежная мухоловки, обыкновенный поползень, пеночки — таловка, зарничка и корольковая, пятнистый сверчок, дрозды — оливковый и рябинник, соловей-красношейка, синехвостка, сибирская завирушка и др.

Значительную роль в орнитофауне заповедника играют виды китайского типа: седоголовая овсянка, сибирский жулан, зеленая пеночка, сибирская горихвостка, белопоясный и иглохвостый стрижи, пятнистый конек, большой подорлик, удод, зимородок, седой дягел, сойка, большая синица. Видов монгольской фауны тоже достаточно: гнездятся степной конек, каменка-плясунья, бледная завирушка, пестрый каменный дрозд. Тибетский тип фауны представлен в заповеднике горным дупелем, горным коньком, краснобрюхой горихвосткой, альпийской и гималайской завирушками. Из птиц европейского типа гнездится только один вид — обыкновенный скворец. Невелик и список арктических видов;гнездятся лишь белая и тундряная куропатки. Из группы так называемых берингийских видов отмечены на гнездовании касатка, каменушка, горбоносый турпан, сибирский вьюрок, полярная овсянка.

Одна из особенностей северо-восточного побережья Байкала — бедность фауны земноводных и пресмыкающихся, как в видовом, так и количественном отношении. Из амфибий здесь встречаются остромордая и сибирские лягушки и сибирский углозуб. Из рептилий — обыкновенный щитомордник, узорчатый полоз, обыкновенный уж, обыкновенная гадюка, прыткая и живородящая ящерицы. Рыб в заповеднике — 50 видов. Фауна беспозвоночных заповедника изучена слабо. По материалам Т.Л. Ананиной, занимавшейся инвентаризацией членистоногих, к 1996г. на территории заповедника было зарегистрировано 1015 видов насекомых и 106 видов паукообразных.