Расчет квантово-химических параметров ФАВ и определение зависимости структура-активность на примере сульфаниламидов
предсказано несколько видов токсичности (гематоксичность (0,833) и эмбриотоксичность (0,339)).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В ходе проведенной работы были рассчитаны геометрические параметры соединений сульфаниламидного ряда и предсказана вероятность проявления ими некоторых видов физиологической активности. Результатом работы стал прогноз ранее неизвестных видов активности у соединений сульфаниламидного ряда, к которым можно отнести агонист Допамина Д4 (проявляется у всех анализируемых веществ с вероятностью 0,581 – 0,941), гематоксичность (проявляется у всех соединений с вероятностью 0,791 – 0,947), эмбриотоксичность (проявляется у сульфафуразола и сульфаниламида с вероятностью 0,339 и 0,495) и другие. Вместе с тем была подтверждена уже известная проявляемая физиологическая активность (антагонист ПАБК), которая оценена на уровне 0,860 – 0,9, что является очень высоким показателем. Как показано в приложениях В – Ж, имеет смысл провести дополнительные доклинические испытания на пример использования их в качестве антиэпилептического назначения.
СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ ИСТОЧНИКОВ
1 Prous J. Drugs Years News[Text] / Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. P 345
2 Djons A. Talidomid as anxiolitic [Text] / Brit. J. Pharmacol., 1960, 15, p.111-116
3 Am. J. Public Health, 1965, 55, p.703-707
4Sridhar B., Ravikumar K. Some interesting properties of talidomid [Text] / Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994, Apr 26; 91 (9):4082-5
5 Clin. Immunol. Immunopathol. 1996, 81, p.219-223
6 Иванов А.С., Арчаков А.И. Интегральная платформа «От гена до прототипа лекарства» in silico и in vivo [Текст] / Иванов А.С. Арачаков А.И. // Российский химический журнал М.: Наука №2, 2006. – с. 18-35
7 Жидомиров Г.М., Багатурьянц А.А. Прикладная квантовая химия.-М.: Химия, 1979.-295 с.
8 Бурштейн К.Я., Шорыгин П.П. Квантово- химические расчеты в органической химии и молекулярной спектроскопии.- М.: Наука, 1989.-310 с.
9 Кузнецов П.Е., Люлин Ю.Н., Щербаков А.А. Методы математического моделирования в приложении к проблеме биофизической химии. ДСП, 1985.-250 с.
10 Hansch C, Fujita Т., р-ст-л Analysis. A Method for the Correlation of Biological Activity and Chemical Structure, J. Am. Chem. Soc, 86, 1616 (1964).
11 Hammett L. P., Physical Organic Chemistry, McGraw-Hill, New York, 1940.
12 Cramer R. D., Quantitative Drug Design, in: Annual Reports in Medicinal Chemistry, Vol. 11, F. H. Clarke (Ed.), Academic, New York, 1976.
13 Silipo C, Hansch C, Correlation Analysis. Its Application to the Structure -Activity Relationship of Triazines Inhibiting Dihydrofolate Reductase, J. Am.Chem. Soc, 97, 6849 (1975).
14 Dixon W. J. (Ed.), BMD - Biomedical Computer Programs, 3rd ed., Universityof California Press, Berkeley, CA, 1973.
15 Furnival G. M., Wilson R. W., Jr., Regressions by Leaps and Bounds, Tech-nometrics, 16, 499 (1974).
16 Стьюпер Э., Брюггер У. Машинный анализ связи химической структуры и биологической активности. Пер. с англ. — М.: Мир, 1982.—235 с, ил.
17 Сборник программ расчета спектральных и квантовохимических параметров молекул. ДСП, 1983.-53 с.
18 Hartigan G. H., Clustering Algoriths, Wiley, New York, 1975.
19 Ball G. H., Hall J. P., ISODATA: A Novel Method of Data Analysis and Pattern Classification, NTIS Report AD699616, 1965.
20 Ball G. H., Hall J. P., ISODATA, An Iterative Method of Multivariate Analysis and Pattern Classification, Proceedings of the IFIPS Congress, 1965.
21 По материалам сайта ChemNet
22 Shroder S., Thiel W. //Ibid. Vol. 108, N 25. P. 7985 - 7989
23 Dewar M.J.S., Ford G.P. // J. Amer. Soc. 1977. Vol. 99, N6. P. 1685-1691
24 Вартанян Р.С. Синтез основных лекарственных средств. – М. Медицинское информационное агентство, 2004. – 845 с.
Приложение А
Таблица А.1 - Абсолютные ошибки, которые получаются при расчете длин валентных связей и значений валентных углов неэмпирическими методами.
Неэмпирический расчет в базисе |
Ошибки | |
Длины валентных связей, нм |
Валентные углы, град | |
ОСТ-3ГФ |
0,002-0,003 |
3-4 |
Валентно - расщепленные базисы, безэкспоненциальные базисы, расширенные базисы без поляризационных орбиталей |
0,001 |
Сильное завышение валентных углов у молекул типа Н2О, NН |
Валентно - расщепленные и безэкспоненциальные базисы с поляризационными орбиталями |
0,0011 |
1-2 |
Хартри- Фоковский предел |
0,005 |
1-2 |
Большие базисы с учетом электронной корреляции |
Очень хорошее согласие с экспериментом |
Примечание 1 - вычисленные значения обычно меньше экспериментальных величин
Таблица А.2 - Абсолютные значения ошибок при расчете длин валентных связей и валентных углов методами МПДП и МЧПДП/3
Геометрический параметр |
Количество расчетов |
Абсолютная ошибка | |
МПДП |
МЧПДП/3 | ||
Валентная связь, нм | |||
Все тины связей |
228 |
0,0014 |
0,0022 |
С-Н |
56 |
0,0009 |
0,0019 |
С-С |
96 |
0,0012 |
0,0016 |
N-H |
9 |
0,0006 |
0,0019 |
N-C |
17 |
0,0010 |
0,0029 |
N-N |
9 |
0,0032 |
0,0074 |
O-H |
7 |
0,0011 |
0,0010 |
O-C |
22 |
0,0016 |
0,0025 |
O-N |
8 |
0,0026 |
0,0026 |
O-O |
3 |
0,0117 |
0,0043 |
Валентный угол, град | |||
Все типы углов |
91 |
2,8 |
5,6 |
Углы при С |
62 |
2,0 |
4,4 |
Углы при N |
15 |
3,2 |
7,1 |
Углы при О |
9 |
8,5 |
10,7 |
Углы между плоскостями в бициклических соединениях |
5 |
1,6 |
5,9 |