Инициатива образования нового субъекта в Российской Федерации принадлежит органам государственной власти субъекта. Совместное предложение законодательных (представительных) органов государственной власти и высших должностных лиц (руководителей исполнительных высших органов государственной власти) заинтересованных субъектов Российской Федерации об образовании в составе Российской Федерации нового субъекта направляется Президенту Российской Федерации. Президент РФ обязан уведомить об этом палаты Федерального Собрания Российской Федерации и правительство Российской Федерации, а в случае необходимости провести с ними необходимые консультации. В случае поддержки Президентом Российской Федерации инициативы заинтересованных субъектов РФ вопрос об образовании в составе РФ нового субъекта в согласованной формулировке выносится на референдумы заинтересованных субъектов РФ. Вынесение вопроса об образовании в составе РФ нового субъекта на референдумы заинтересованных субъектов РФ с различиями в его формулировке не допускается.

Инициатива проведения референдума по вопросу образования в составе Российской Федерации нового субъекта принадлежит высшим должностным лицам (руководителям исполнительных высших органов государственной власти) заинтересованных субъектов РФ. После этого в субъектах РФ должен быть проведен референдум по вопросу образования в составе РФ нового субъекта, назначение, подготовка и проведение которого осуществляется в соответствии с законами заинтересованных субъектов РФ о референдуме, принятыми в соответствии с Федеральным законом "Об основных гарантиях избирательных прав и права на участие в референдуме граждан РФ". Если на референдумах будут приняты соответствующие решения по вопросу об образовании в составе Российской Федерации нового субъекта, вносится проект федерального конституционного закона об образовании в составе РФ нового субъекта в Государственную Думу Федерального Собрания. Такой проект может внести только Президент Российской Федерации в соответствии с правом законодательной инициативы.

При этом в нижней палате за него должны проголосовать не менее 2/3 депутатов Государственной Думы. Затем за данный федеральный конституционный закон должны проголосовать не менее ? от общего числа членов Совета Федерации.

В настоящее время вступили и действуют ФКЗ 25 марта 2004 года №1 – ФКЗ "Об образовании нового субъекта Российской Федерации в результате объединений Пермской области и Коми-Пермяцкого автономного округа", ФКЗ от 14 октября 2005 года "Об образовании в составе Российской Федерации в результате объединения Красноярского края, Таймырского (Долгано-Ненецкого) автономного округа и Эвенкийского автономного округа". В соответствии с Федеральным конституционным законом от 1 декабря 2005 года образован Пермский край и с 1 января 2007 года образован Красноярский край с вошедшим в его состав Таймырским и Эвенкийским автономными округами.

Федеральные конституционные законы регламентируют организационные, финансовые, экономические и другие вопросы, связанные с объединением регионов. Федеральный конституционный закон "Об образовании в составе Российской Федерации нового субъекта РФ в результате объединения Красноярского края, Таймырского (Долгано-Ненецкого) автономного округа и Эвенкийского автономного округа" предусматривает основные условия, процедуру и срок образования нового субъекта РФ, его наименование, статус, границы, срок прекращения существования Красноярского края, Таймырского (Долгано-Ненецкого) и Эвенкийского округов, а также переходный период образования нового субъекта Российской Федерации, начиная с января 2007 года и не позднее 31 декабря 2007 года. В течение указанного переходного периода должно быть завершено формирование органов государственной власти нового субъекта Российской Федерации. Законом определяются порядок подготовки и принятия бюджетов нового субъекта РФ на 2007-2008 годы из федерального бюджета, порядок функционирования до завершения переходного периода государственных органов и организаций края и автономных округов, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти, федеральных судов на территории нового субъекта Российской Федерации, а также правопреемство нового субъекта Российской Федерации, в том числе и в отношении собственности края и автономных округов, порядок действия законов и иных нормативных правовых актов края и автономных округов на территории нового субъекта Российской Федерации. Законом также регулируются особенности организации деятельности местного самоуправления на территории и другие вопросы.

23 декабря 2005 года прошел референдум по объединению Камчатской области и Корякского автономного округа. По результатам референдумов по объединению Иркутской области и Усть-Ордынского Бурятского автономного округа, состоявшихся 14 апреля 2006 года, большинством голосов принято решение по объединению.

Сейчас обсуждается возможность объединения Архангельской области и Ненецкого автономного округа, Хабаровского края с Еврейской автономной областью, Санкт-Петербурга с Ленинградской областью, Псковской области с Новгородской, Липецкой с Воронежской и другие.

Процесс укрупнения регионов может быть продолжен только в случае обеспечения реального комфортного существования всех и каждого в отдельности человека в регионе. В противном случае при укрупнении субъектов неизбежно возникнут противоречия в финансово-экономическом неравенстве, затем возникнут проблемы межнациональных противоречий, что осложнится влиянием национального исторического самосознания проживающих там народов, негативно воспринимающих любые притязания соседей на их территорию. Это обусловлено тем, что в республиках, в особенности на Северном Кавказе, консолидирующим фактором является не экономика и религия, а самосознание.

Исходя из указанных существующих проблем, необходимо принятие комплексной концепции модернизации федеративной системы Российской Федерации, в которой должны быть закреплены основные цели и задачи укрупнения регионов с проработкой всего комплекса вопросов. Одним из ключевых блоков в концепции должен стать национальный вопрос, который исключил бы негативные межнациональные отношения.

Без учета всех факторов, влияющих на процесс укрупнения и радикальной реформы всей государственности и крупномасштабной конституционной реформы, невозможно обеспечение конституционного права на присоединение или объединение регионов.

Однако идея модернизации и совершенствования федеративных отношений не может сводиться к очередному раунду перераспределения полномочий и доходных источников разного уровня. Горегляд В.П., заместитель председателя Совета Федерации (Н.Г. от 24 декабря 2003 года) считает, что для реализации новой политики укрупнения регионов нужна политика федерального, а не унитарного государства. Это предполагает решение двух взаимосвязанных задач. Во-первых, необходимо, чтобы законодательство в сфере развития федеративных отношений не отрывалось от социально-экономических реалий. Сегодня предпринимается попытка во-первых, закрепить полную централизацию государственной собственности на природные ресурсы, что не отвечает формальному балансу экономических интересов федерации; во-вторых, выработать основы федеральной региональной политики. Федеральный центр, укрупняя субъекты РФ, в долгосрочной перспективе может надеяться на уменьшение размеров финансовой помощи субъектам РФ, но в настоящее время в программу укрупнения субъектов необходимо вложить немереные деньги. При этом никакого расчета финансового обоснования, как эти проекты окупятся в будущем, сделано не было; чтобы хотя бы знать, а какой смысл? То, что крупные субъекты будут более управляемы - слабое обоснование, и не соответствует действительности.