Создание новых лекарственных веществ
Сравнивая полученные результаты, оба метода имеют небольшие отклонения.
Расположение молекулы немного изменяется в зависимости от применяемого метода.
Положительный знак электростатического потенциала отображается зелёным цветом. В области неподелённых пар на атомах азота, кислорода электрический потенциал отрицательный, что отображается красным цветом.
Изменение потенциальной энергии связи C6-С11.
Исследуемая связь между атомами C6-С11. Задаём начальные величины начальная длина связи 1,037; конечная длина связи 3,037; шаг 0,1. Проведя расчёты, изобразим график изменения потенциальной энергии связи C6-C11 от величины растяжения.
Изменение потенциальной энергии углового напряжения C6-C11-O14.
Исследуем угол между атомами C6-C11-O14. Задаём начальные величины начальный угол 90; конечный 150; шаг 10. Проведя расчёты, изобразим график изменения энергии углового напряжения при изменении величины угла.
Объектом является химическое соединение.
Таблица 3
|
Длина связи или валентный угол |
Данные ММ расчёта |
Данные MNDO расчёта |
Справочные величины |
|
O1-C2 C2-C3 C3-C4 C4-C5 C5-C7 C6-C7 C2-C6 C3-O8 C5-C9 C9-C10 C10-N11 N11-C12 N11-C13 C13-C14 C14-C15 C15-C16 C16-C18 C17-C18 C13-C17 C16-C19 C19-C20 C19-O21 O21-C22 C22-C23 C23-N24 N24-C25 N24-C26 O1-C2-C6 O2-C2-C3 C2-C3-C4 C3-C4-C5 C4-C5-C7 C5-C7-C6 C2-C6-C7 C3-C2-C6 O8-C3-C2 O8-C3-C4 C4-C5-C9 C7-C5-C9 C5-C9-C10 C9-C10-N11 C10-N11-C12 C13-N11-C12 C14-C13-N11 C17-C13-N11 C13-C14-C15 C14-C15-C19 C15-C16-C18 C16-C18-C17 C13-C17-C18 C17-C13-C14 C19-C16-C18 C19-C16-C15 O20-C19-C16 O21-C19-C16 O20-C19-O21 C19-O21-C22 O21-C22-C23 C22-C23-N24 C23-N24-C25 C23-N24-C26 C25-N24-C26 |
1,36051 1,34612 1,34441 1,3441 1,34399 1,34099 1,34297 1,36079 1,51602 1,54091 1,46417 1,45765 1,35257 1,3425 1,34235 1,34536 1,34524 1,34278 1,34206 1,36228 1,21202 1,35004 1,4099 1,53786 1,45675 1,45323 1,45163 120,802 120,483 119,222 122,579 117,432 120,669 121,368 118,714 120,184 120,594 121,181 121,385 115,402 114,762 123,704 116,621 120,198 119,72 120,071 119,877 120,004 119,927 120,013 120,082 119,383 120,612 119,581 120,826 119,469 119,174 110,679 113,688 111,433 113,311 111,143 |
1,35748 1,43712 1,4148 1,41582 1,41064 1,4048 1,41425 1,35924 1,51423 1,55179 1,47428 1,47004 1,43737 1,41646 1,40524 1,41186 1,41199 1,4048 1,41809 1,501 1,22707 1,36061 1,41166 1,5624 1,47048 1,46449 1,46417 123,264 118,062 119,488 121,583 118,032 121,572 120,637 118,674 117,63 122,882 121 120,916 117,262 113,931 116,04 114,642 123,731 117,39 120,376 120,696 118,949 120,676 120,373 118,878 120,928 120,123 126,438 112,643 120,919 125,616 107,249 109,754 116,591 116,835 115,996 |
1,359 1,381 1,368 1,388 1,347 1,358 1,413 1,362 1,514 1,551 1,469 1,462 1,395 1,561 1,395 1,354 1,456 1,400 1,346 1,447 1,210 1,369 1,469 1,537 1,475 1,462 1,495 122,645 119,472 119,265 121,583 117,463 120,873 121,145 118,714 118,139 121,246 121,012 121,213 114,786 113,746 122,612 115,621 120,198 118,365 120,376 120,519 119,789 120,581 120,373 120,566 120,491 120,573 122,469 117,721 120,651 123,125 108,452 110,956 117,854 114,651 113,786 |
Сравнивая полученные результаты, оба метода имеют небольшие отклонения.
Расположение молекулы немного изменяется в зависимости от применяемого метода.
Положительный знак электростатического потенциала отображается зелёным цветом. В области неподелённых пар на атомах азота, кислорода электрический потенциал отрицательный, что отображается красным цветом.
Изменение потенциальной энергии связи N11-С13.
Исследуемая связь между атомами N11-С13. Задаём начальные величины начальная длина связи 2,36; конечная длина связи 5,666; шаг 0,1. Проведя расчёты, изобразим график изменения потенциальной энергии связи N11-С13 от величины растяжения.
Изменение потенциальной энергии углового напряжения C19-О21-С22.
Исследуем угол между атомами C19-О21-С22. Задаём начальные величины начальный угол 70; конечный 130; шаг 10. Проведя расчёты, изобразим график изменения энергии углового напряжения при изменении величины угла.
Оптимизация геометрии и расчёт параметров молекулы методом молекулярной механики (ММ+ и MNDO метод).
Таблица 4
|
Длина связи или валентный угол |
Данные ММ расчёта |
Данные MNDO расчёта |
Справочные величины |
|
С1-С2 С2-С3 С3-С4 С4-N5 N5-C6 C6-C7 C7-C8 C41-C8 C9-C41 C5-C9 C7-C10 C10-O11 C10-O12 O12-C13 C13-C14 C14-N15 N15-C16 N15-C17 C1-C1-C3 C2-C3-C4 C3-C4-N5 C4-N5-C6 C4-N5-C9 N5-C6-C7 C6-C7-C8 C7-C8-C41 C8-C41-C9 C41-C9-N5 C9-N5-C6 C6-C7-C10 C8-C7-C10 C7-C10-C11 C7-C10-O12 C10-O12-O13 O12-C13-C14 C13-C14-N15 C14-N15-C16 C14-N15-C17 C16-N15-C17 |
1,53455 1,53762 1,5369 1,468 1,45685 1,5104 1,34294 1,34042 1,33896 1,35217 1,36168 1,21147 1,34976 1,41025 1,53651 1,45706 1,45297 1,4518 111,892 111,685 111,781 122,06 119,167 114,299 120,314 120,526 122,338 123,23 118,447 121,465 118,218 117,423 122,29 118,494 107,986 113,797 111,518 113,334 111,185 |
1,53153 1,54118 1,55042 1,47213 1,4767 1,51705 1,36463 1,44632 1,36782 1,39475 1,49687 1,22888 1,36285 1,41128 1,56218 1,47138 1,46379 1,46434 114,534 113,462 113,494 118,349 119,969 113,836 121,488 120,452 120,512 121,692 121,63 116,046 122,464 126,415 113,517 125,248 107,536 109,6 116,738 116,78 115,933 |
1,532 1,538 1,542 1,468 1,463 1,517 1,352 1,395 1,338 1,394 1,419 1,226 1,339 1,411 1,541 1,468 1,462 1,468 113,589 113,452 113,642 119,486 119,165 113,863 121,488 120,526 121,514 122,945 119,449 120,064 118,218 126,435 122,651 125,984 107,892 110,674 115,465 115,639 113,746 |
