Под руководством полевого командира-анархиста Пракседиса Герреро МЛП мобилизовала свои 44 подпольных партизанских отряда на конец 1906 г., рассчитывая на массовое восстание. В сентябре Рикардо Флорес Магон и Хунта тайно перенесли свою штаб-квартиру в Эль-Пасо (Техас). Большинство выступлений было сорвано скоординирован-ными арестами сотен активистов в США и Мексике. Но 3 акции все же состоялись. 300 человек под командованием Донато Падуа попытались захватить город Акайюкан (штат Веракрус), но потерпели поражение и отступили в сельские районы, где продолжали партизанскую борьбу до революции 1910 г. и соединения с силами Сантаны Родригеса (Сантанона). МЛП возглавила восстания индейцев в Чинамеке, Минатитлане и Ишуатлане в штате Веракрус; все они были подавлены, некоторые из уцелевших присоединились к Падуа. Третья неудачная атака была организована из техасского Дель-Рио на Хименес (штат Коауила). В октябре был разгромлен отряд МЛП около Сьюдад-Камарго в Та-маулипасе. План захватить Сьюдад-Хуарес из Дель-Рио не был осуществлен. Рикардо Флорес Магон сумел бежать и укрылся в Лос-Анджелесе, где Хунта была реорганизована.

Стачка текстильщиков и восстание рабочих в Рио-Бланко в 1906-1907 гг. происходили вне непосредственного участия МЛП, но под влиянием ее идей. Уже в 1901 г. рабочие Рио-Бланко (в текстильном регионе Орисаба-Пуэбло) создали «либертарное мютюалистско-кооперативное общество» и тайную «группу сопротивления». В 1903 г. они провели забастовку против произвола надсмотрщиков, в 1904 г. создали «Большой круг». Весной 1906 г. эмиссар МЛП Хосе Нейра приехал в Рио-Бланко и начал работать в протестантском религиозном кружке Х.Румбиа, исповедовавшем смесь фундаменталистского христианства и радикального популизма. 2 апреля 1906 г. Нейра, Румбиа и ядро из 27 ра-бочих создали «Большой круг свободных рабочих» во главе с Нейрой. «Круг» решил вступить в МЛП, организовал секции на фабриках Санта-Роса и Ногалес и начал издавать газету «Ла Револусьон сосиаль». Летом того же года митинг «Круга» был разогнан сельскими гвардейцами «руралес»; организация была распущена, большинство активистов скрылось. Власти создали новый, соглашательский «Большой круг», но тот не смог удержать рабочих от выступления. В декабре 1906 г. рабочие потребовали сокращения рабочего дня в субботу, предоставления перерыва на обед, отдыха по праздничным дням, введения пенсий, оплаты сверхурочных, ликвидации полицейского режима на предприятиях и введения доступа профсоюзов на предприятия, запрещения магазинов компаний и детского труда. На митинге согла-шательского профсоюза 7 декабря один из рабочих призвал к «революции классовой борьбы». Было решено басто-вать. Так вспыхнула стачка 6 тысяч текстильщиков Пуэблы, к которой затем примкнули 800 рабочих Тлашкалы. В ответ 22 декабря предприниматели объявили локаут 22 тысяч рабочих в Пуэбле, 10 тысяч в Орисабе, 25 тысяч в Мехико, Веракрусе, Керетаро и Гвадалахаре. После правительственного посредничества предприятия и обещания предприни-мателей не допускать труда детей моложе 7 лет предприятия были снова открыты 7 января. Однако часть рабочих и даже местное руководство профсоюзов в Санта-Росе выступили против «соглашения». В Рио-Бланко в Орисабе рабочие-противники «договоренности» помешали другим войти на фабрику. Вспыхнуло антиправительственное восстание, были разгромлены магазины, солдаты открыли огонь: были убиты 17 рабочих, 80 ранены. Восставшие захватили тюрьму и освободили заключенных. Часть рабочих двинулась на фабрики «Ногалес» и «Санта-Роса» и вместе с их работниками захватили эти предприятия, сожгли магазины компаний. По возвращении они снова попали под армейский огонь; последовали новые жертвы. В Рио-Бланко рабочие заняли железнодорожную станцию и сожгли несколько до-мов, в том числе лидера официального «Большого круга». Перестрелки между рабочими и солдатами продолжались всю ночь. На следующий день Орисаба была занята подоспевшими войсками; сотни рабочих были арестованы, толпа рабочих была расстреляна перед фабрикой «Санта-Роса», 5 человек были убиты. Всего в ходе стачки погибли более 200 рабочих и 25 солдат; 30-40 солдат были ранены, 400 рабочих арестованы, 1500 человек уволены. Власти назвали выступление «коммунистическим».

В 1907-1910 гг. рабочие волнения продолжались в Орисабе, Пуэбле, городе Мехико; для их подавления неоднократно концентрировались войска. В январе 1907 г. бастовали рабочие текстильной фабрики «Ла-Магдалена» в Сан-Анхеле около столицы, к ним присоединились работники «Ла-Ормиги», но выступление было подавлено армией, занявшей фабрики. В апреле 1907 г. вновь бастовали рабочие фабрик «Ногалес» и «Рио-Бланко», безуспешно добиваясь ликвидации полицейского режима. В 1908 г. стачки снова прокатились по столице, Пуэбле и Орисабе с эпицентром в Сан-Анхеле. На следующий год состоялись 2 стачки на крупнейшей текстильной фабрике в Мехико - «Сан-Антонио-де-Абад» (по вопросам увольнений и сокращения зарплаты); обе закончились неудачей. Снова и снова вспыхивали за-бастовки и волнения рабочих в районе Пуэблы. Рабочие «Рио-Бланко» пытались несколько раз выступить в 1909 г. В июле 1910 г. одновременно с активизацией партизан МЛП во главе с Падуа и Сантаноном забастовали 600 рабочих «Санта-Росы»; стачка была подавлена войсками .

Несмотря на неудачу в 1906 г. МЛП в 1907 г. активизировала свои усилия. Под руководством анархиста Пракседи-са Герреро осуществлялся сбор оружия, готовились подпольные группы. Но в августе полиция в Лос-Анджелесе арестовала членов «Хунты» - Р.Флореса Магона, Л.Риверу, А.Вильяреаля, М.Диаса. Подготовка к восстанию продолжалась под руководством Э.Флореса Магона и П.Герреро. В 1908 г. существовали 40-60 тайных групп, которые должны были начать вооруженную борьбу с режимом. Но выступление в июне было сорвано репрессиями американских и мексиканских властей. Группа из 20 членов МЛП была окружена в Касес-Грандес (Чиуауа), в Эль-Пасо полиция захватила дом военного руководителя МЛП П.Сильвы, арестовала ряд активистов и конфисковала большое количество оружия, бомб и амуниции. Войска США блокировали границу. 26 июня в Лас-Вакасе вспыхнули бои между отрядами МЛП и местным гарнизоном. Группа из 50 членов партии в Касас-Грандесе атаковала пограничный город Паломас. Однако помощь от сил МЛП в США придти не смогла. Серия мелких восстаний МЛП в Лас-Орносе, Матаморосе и Ла-Сьерра-де-Химилко (Коауила) не удалась.

Между тем, расхождения в МЛП нарастали. В письме, написанном из тюрьмы в Лос-Анджелесе в 1908 г., Р.Флорес Магон призвал своих сторонников развернуть открытую пропаганду анархистских идей. Позднее арестован-ные активисты МЛП были переведены в Томбстоун (Аризона) и осуждены в результате сфабрикованного процесса. Рикардо Флорес Магон был приговорен к 18 месяцам тюрьмы в Юме (Аризона). Вся тяжесть военной подготовки лежала теперь на П.Герреро. Он начал организовывать мексиканских рабочих в Аризоне, Нью-Мексико и Техасе, собирать средства на публичных митингах. Одновременно партизанские отряды МЛП действовали в Веракрусе и Коауиле.