В период 15-летнего правления ревностного и деятельного строителя Иоасафа в обители в числе прочего были построены каменные насто ятельские и братские кельи; количество монаше ствующих весьма умножилось. 1 апреля 1794 года Иоасаф отошел в вечность. Отпевал его владыка Платон, чьи стихи начертали на надгробии насто ятеля у алтаря Троицкого собора.

Труды Иоасафа в 1794-1806 годах продолжил его родной брат иеромонах Николай, стараниями которого вокруг пустыни появилась каменная огра да, а к постройкам прибавилась братская трапезная. Также владыка Платон распорядился перенести на монастырское кладбище из села Топоркова деревян ную Казанскую церковь, где его когда-то крестили. В 1828 году настоятелем становится пострижен ник Соловецкого монастыря иеромонахАнтоний. 14 июня 1829 года в его настоятельство в Никола евской Берлюковской пустыни была чудесно обре тена икона, именуемая «Лобзание Христа Спасите ля Иудою». Произошло это так. В селе Кудиново жила Татьяна Ивановна Кузнецова, в продолжение двадцати лет страдавшая полной слепотой и тяж кими глазными болями. Разуверившись во врачах, она с тем большим усердием молила Господа об исцелении. Однажды во сне ей явился некий муж с иконой Спасителя и сказал: «Отправляйся в Берлюковскую пустынь, там найдешь эту икону, отслужи перед нею молебен и получишь прозре ние». Она пришла в обитель, где по ее указанию в хлебне (пекарне) обнаружили древний образ, до того потемневший от времени, что едва можно было распознать изображение. Его омыли, очисти ли и стали спрашивать Кузнецову, что видела она во сне. «Твердо помню, что позади Спасителя стояли два воина: один держал Его руки, другой поднял кверху веревки, а спереди Иуда окаянный лез Его целовать». Именно этот сюжет и открылся на иконе! Тут же совершили молебен, больной да ли испить святой воды. Когда она омочила ею гла за, струпы мгновенно спали и женщина прозрела. Весть об этом мгновенно разлетелась по округе. На следующий день великое множество народа из окрестных сел и деревень стеклось в монастырь, где пред чудотворной иконой с раннего утра до глу бокой ночи совершались молебны. В десятое воскре сенье по Пасхе, 16 июня 1829 года, икону торжест венным крестным ходом перенесли из хлебни в Тро ицкий собор на специально устроенное для нее место в приделе святителя Николая.

В конце июня 1829 года скончался иеромонах Ан тоний. С благословения митрополита Московского Филарета (Дроздова) новым строителем пустыни на значается иеромонах Венедикт, бывший до того эко номом Свято-Троицкой Сергиевой лавры, - деятель ный, умный, обходительный, для обители неусыпно старательный, в управлении взыскательный, к себе и братии строгий. Главное дело его управления - воз ведение (на средства московского купца Афанасия Емельяновича Щекина) соборного храма Христа Спасителя, заложенного в августе 1835 года и освя щенного в 1848 году митрополитом Филаретом. В 1832-1833 годах на подворье у Каменного моста в Москве был построенвзамен старого де ревянного каменный двухэтажный корпус с часов ней святителя Николая, в которой поместили список с чудотворного образа «Лобзание Христа Спасителя Иудою», иконы святителя Николая с частицами мощей, Иоанна Воина, а также часть мантии преподобного Сергия Радонежского.

В 1834 году по случаю пожаров, опустошавших город Богородск, его граждане испросили у епархи ального начальства разрешения отпустить к ним из пустыни чудотворную икону «Лобзание .» для участия ее в крестном ходе 1 октября, в день Покрова Пресвятой Богородицы. Святейший Си нод позволил отпускать икону ежегодно. Пожары прекратились. Одновременно московский купец Петр Семенович Бабкин тоже просил отпустить икону к нему на фабрику в село Купавну, ибо он тяжело болел и не мог сам приехать в пустынь. Митрополит Филарет дал на это свое благослове ние. П. С. Бабкин получил немедленное исцеление. Так было положено начало знаменитых Богород ских крестных ходов. В 1864 году чудотворный об раз посетил множество селений Богородского, Мо сковского и Дмитровского уездов, Павловский По сад. В десятое воскресенье по Пасхе в пустыни еже годно совершалось празднование в память перене сения его из хлебни в Троицкий собор, собиравшее большое количество богомольцев.

В 1840 году в обители освящена новая каменная одноглавая надвратная церковь Василия Великого; в 1844-м построена каменная часовня при деревне Псарьки на Владимирской дороге; в 1851-м - каменная двухъярусная колокольня, на которую подняли колокол весом в 1005 пудов с надписью, гласившей, что отлит он «в царствование Благоче стивейшего Государя Императора Николая Павло вича, Самодержца Всероссийского, и по благослове нию Его Высокопреосвященства Филарета, митро полита Московского, и при игумене пустыни Вене дикте 1851 года октября 3 дня». Всего в пустыни имелось 13 колоколов и старинные медные била. В 1853 году митрополит Филарет освятил оби тельскую церковь Всех Святых - каменную, одно главую, с хорами, куда вел ход из настоятельских келий, примыкавшихс северной стороны. При цер кви устроили кельи и для больных старцев. Иконы посвящались исцелениям Господним; великолепный резной вызолоченный иконостас изготовил мастер Павел Константинов из Купавны. Эта церковь, по ставленная на том самом памятном месте, где рань ше была хлебня, возводилась на средства купца из города Фридрихсгам (ныне город Хамина в Фин ляндии) Федора Федоровича Набилкина, в 1842- 1844 годах финансировавшего строительство боль шей части скита Всех Святых на Валааме. За свои неусыпные труды отец Венедикт в 1840 го ду был возведен в сан игумена, а в 1853-м - в сан архимандрита; в 1842 году он удостоился золотого наперсного креста от Святейшего Синода. В 1828 году в пустынь пришел крепостной человек московских купцов Куманиных Макар, за добрую жизнь отпущенный ими на волю. В 1829 го ду Макар принял монашеский постриг с именем Афанасий, в 1841-м - схиму с именем Макарий. Отличался он подвижнической жизнью и необык новенным трудолюбием, в свободные часы копал пещеры на речном берегу и однажды чудесно об рел там святой источник, близ которого устроил несколько келий и часто в них пребывал. Множе ство людей приходило к нему за советом, утеше нием, наставлением. Скончался схимонах Мака рий 1 апреля 1847 года.

Иеромонах Феодорит родился в 1783 году. В 1815 году поступил в Троице-Сергиеву лавру, принял монашество; в 1827-м перешел в Берлю ковскую пустынь, где прожил 36 лет. Феодорит присутствовал при чуде обретения иконы «Лобза ние .» Ученик, друг и собеседник схимонаха Ма кария, он уподобился ему по силе подвигов. По следние шесть лет жизни, удрученный старостью и тяжелой болезнью, Феодорит пролежал на спи не без движения, не преставая творить молитвы и духовно окормлять братию и многих притекав ших к нему извне людей. Умер он 27 февраля 1863 года и был похоронен рядом с Макарием у Казанского храма.

В 1855 году отошел в вечность архимандрит Венедикт. Его погребли в склепе под собором Христа Спасителя. Преемником отца Венедикта в 1856 году стал иеромонах Парфений. До этого он побывал в Иерусалиме, Палестине и в Кон стантинополе, в 1851 году по благословению афонских старцев прибыл в Россию и был зачис лен в Гефсиманский скит. Вскоре (1856) вышла его книга «Сказание о странствиии путешествии по России, Молдавии, Турции и Святой Земле», получившая всероссийскую известность. Тогда же Парфения рукоположили в сан иеромонаха и назначили настоятелем Берлюковской пустыни. Он полностью перестроил Казанскую церковь, на колокольне которой поднял колокол весом в 120 пудов (в этой церкви находился древний список Казанской иконы Божией Матери в жи тии, почитаемый окрестным населением как чудо творный). Отец Парфений, пользовавшийся боль шим уважением митрополита Филарета, написал ряд ярких апологетических и обличительных сочинений против раскольников.