Процедура Назначения референдума описана в статье 16:

1. Референдум назначается в соответствии с Конституцией и Федеральным конституционным законом.

2. Референдум субъекта Российской Федерации назначается органом государственной власти субъекта Российской Федерации в соответствии с настоящим Федеральным законом, Конституцией, уставом, законом субъекта Российской Федерации.

3. Местный референдум назначается органом местного самоуправления в соответствии с настоящим федеральным законом, законом субъекта Российской Федерации, уставом муниципального образования.

4. Референдум назначается только на календарный выходной день. Не допускается назначение референдума на праздничный день. Решение о проведении референдума Российской Федерации, референдума субъекта Российской Федерации должно быть опубликовано не менее чем за 60 дней до дня голосования, местного референдума – не менее чем за 45 дней.

5. В соответствии с законом субъекта Российской Федерации, уставом муниципального образования дата проведения референдума не позднее чем за 25 дней до референдума может быть перенесена на более поздний срок (но не более 90 дней) уполномоченным на то органом в целях совмещения референдума с иным референдумом либо выборами. Решение о назначении референдума, а также о перенесении даты голосования в соответствии с пунктом 5 настоящей статьи публикуется в СМИ не позднее чем через 6 дней со дня его принятия.

Статья 14 перечисляет обстоятельства, исключающие проведение референдума:

1. Референдум не проводится в условиях военного или чрезвычайного положения на территории референдума, а также в течение трех месяцев после отмены военного или чрезвычайного положения.

2. Законом субъекта Российской Федерации может быть установлен срок, в течение повторный референдум с такой же по смыслу формулировкой вопроса не проводится. Указанный срок не может превышать двух лет со дня официального опубликования результатов референдума.

3. Не допускается установление обстоятельств, исключающих проведение референдума, за исключением указанных в данной статье.

В статье 15 содержится ряд норм, регламентирующих порядок выдвижения инициативы проведения референдума, подготовки и проведения референдума:

- Инициатива проведения референдума в Российской Федерации принадлежит гражданам Российской Федерации, имеющим право на участие в референдуме. Законы могут определять иных субъектов.

- Каждый гражданин или группа граждан, имеющих право на участие в референдуме, а равно общественные объединения, зарегистрированные органами юстиции не позднее, чем за шесть месяцев до дня обращения с инициативой проведения референдума.

- Для назначения референдума субъекта Российской Федерации в орган, установленный законом субъекта Российской Федерации, должны быть представлены подписи участников референдума в поддержку инициативы его проведения.

- Законами субъектов Российской Федерации может быть предусмотрена реализация инициативы проведения местного референдума также в форме собрания участников референдума.

В статье 33 Закона устанавливается минимальный количественный состав инициативной группы по проведению референдума субъекта Российской Федерации (не менее 20 человек), местного референдума (не менее 10 человек).

В статье 13 Закона установлен перечень вопросов, которые не могут быть вынесены на референдум:

1. Вопросы, подлежащие вынесению на референдум Российской Федерации, а также вопросы, котоыре не могут быть вынесены на референдум Российской Федерации, определяются федеральным конституционным законом.

2. На референдум субъекта Российской Федерации могут быть вынесены вопросы, находящиеся в ведении субъекта Российской Федерации.

3. На референдум субъекта Российской Федерации, местный референдум не могут быть вынесены вопросы:

- о досрочном прекращении или продлении срока полномочий, приостановлении осуществления полномочий органа власти, а также о проведении досрочных выборов.

- о формировании состава органов государственной власти субъекта Российской Федерации или органов местного самоуправления, персональном составе органов государственной власти субъектов Российской Федерации и органов местного самоуправления.

- об избрании, утверждении, о назначении либо о даче согласия на назначение, на должность или на освобождение от должности депутатов и должностных лиц.

- о принятии или об изменении соответствующего бюджета, изменении и исполнении финансовых обязательств субъекта финансирования, обязательств субъекта Российской Федерации, муниципального образования

- о принятии чрезвычайных и срочных мер по обеспечению здоровья и безопасности населения.

5. Вопросы, выносимые на референдум Российской Федерации, не должны ограничивать или отменять общепризнанные права и свободы человека и гражданина.

6. Вопрос должен быть сформулирован таким образом, чтобы на него можно дать только однозначный ответ.

8. Не допускается установление ограничений для вопросов, выносимых на референдум, за исключением указанных в данной статье.

В силу пункта 9 статьи 33 Федерального закона избирательные комиссии (комиссии референдума) должны проверять соответствие вопросов референдума этим требованиям. В том числе возможно и проведение филологической экспертизы.

Федеральным законом предусмотрено, что фонды для участия в референдуме создаются в порядке, предусмотренном федеральными конституционными законами, законами субъектов РФ, уставами муниципальных образований (пункт 19 статьи 47)

Федеральным законом "Об основных гарантиях избирательных прав граждан Российской федерации" введено понятие "регистрация участников референдума"(статья 17). Согласно пункту 8 статьи 22 Центральная избирательная комиссия Российской Федерации совместно с федеральными органами государственной власти, избирательными комиссиями субъектов Российской Федерации, исполнительными органами государственной власти субъектов Российской Федерации и органами местного самоуправления организует государственную систему регистрации (учета) избирателей, участников референдума и участвует в осуществлении этих функций.

В целях устранения "двойного учета" уточнен порядок составления участников референдума. Так, в соответствии с пунктом 5 статьи 18 Федерального закона основанием для включения гражданина РФ в эти списки на конкретном участке является факт его постоянного или преимущественного проживания на территории этого участка, определяемый в соответствии с федеральным законодательством.

В соответствии с частью 3 статьи 55 Конституции Российской Федерации, устанавливающей, что права и свободы человека могут быть ограничены Федеральным законом только в той части, в какой это необходимо в целях защиты прав и законных интересов других лиц, в пункте 6 статьи 18 Закона применительно к проведению референдума включено положение о том, что при их проведении военнослужащие, проходящие воинскую службу по призыву в воинских частях, расположенных на территории соответствующего муниципального образования, в списки не включаются, если они не являлись жителями данного муниципального образования на момент призыва (пункт 6 статьи 18).