Сегментация изображений гистологических объектов
Рефераты >> Медицина >> Сегментация изображений гистологических объектов

Разработана система координат описания цвета, специализированная на выполнении операций математической морфологии на цветных изображениях. Использование этой системы координат даёт возможность улучшить качество получаемого результата и увеличить скорость по сравнению с обработкой в традиционных системах координат.

Экономическая и практическая значимость полученных результатов

Использование алгоритмов сегментации гистологических объектов способствует повышению эффективности работы исследователя и получению более качественных и точных результатов измерения характеристик гистологических объектов.

Разработанные алгоритмы и программный комплекс, используемые в настоящее время в научных и диагностических процессах, являются экономически эффективными за счёт снижения затрат на ручной труд при измерении и классификации гистологических объектов.

Алгоритмы и программный комплекс анализа и обработки медицинских изображений внедрены и используются в учебных, научных и диагностических процессах двух медицинских вузов (Минском государственном медицинском институте, Гродненском государственном медицинском институте) и трёх НИИ (Бел НИИ эпидемиологии и микробиологии (г.Минск), Бел НИИ онкологии медицинской радиологии (г.Минск), Институте биохимии НАН РБ (г.Гродно)) Республики Беларусь, а также в двух медицинских вузах (Саратовской государственной медицинской академии, Ярославльской государственной медицинской академии), Институте физиологии детей и подростков РАМН (г.Москва) и Всероссийском центре пластической хирургии глаза МПЗП РФ (г.Уфа) Российской Федерации.

Разработанные методы и алгоритмы могут также включаться в существующие либо разрабатываемые коммерческие системы анализа и обработки гистологических объектов как общеупотребительные, так и узкоспециализированные.

Основные положения диссертации, выносимые на защиту:

- классификация гистологических объектов для определения метода сегментации изображений гистологических объектов;

- алгоритм полутонового утоньшения объектов на слабоконтрастных изображениях гистологических объектов;

- алгоритм сегментации и отслеживания сосудов или волокон при больших оптических увеличениях;

- алгоритм морфологической сегментации отдельных клеток;

- алгоритм сегментации клеток со сложным фоном, основанный на объединении областей;

- алгоритм определения клеток на бинарном изображении, полученном с помощью пороговой сегментации;

- координаты описания цвета, предназначенные для работы методов математической морфологии и других сложных полутоновых операций на изображениях гистологических препаратов.

Личный вклад соискателя

Все предлагаемые алгоритмы были разработаны и программно реализованы лично автором. Научный руководитель принимал участие в постановке задач, определении возможных путей решения и их предварительном анализе.

Апробация результатов диссертации

Основные результаты работы докладывались и обсуждались на конференциях и симпозиумах: научно-технической конференции по компьютерной графике и анимации (Минск, 1993), 8th International Symposium on Diagnostic Quantitative Pathology. (Amsterdam, The Netherlands, 1994), Третей научной конференции по распознаванию и анализу изображений (Минск, 1995), I конгрессе Международной ассоциации патологоанатомов (г.Москва, 1995), республиканской научной конференции молодых ученых и студентов “Актуальные проблемы современной медицины” (Минск, 1997), System and signals in Intelligent Technologies (Минск, 1998), V международной конференции “Компьютерный анализ данных и моделирование” (8-12 июня 1998, Минск), Fifth International Conference Pattern Recognition and Information Processing PRIP99 (Минск, 18 - 20 мая 1999).

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Во введении обоснована актуальность темы, кратко излагается состояние предметной области, нерешенные задачи и даётся краткая характеристика работы.

В первой главе выполнен анализ состояния предметной области: дано описание гистологических объектов и особенностей их изображений, обзор существующих методов систем обработки медицинских изображений, а также описание основных направлений развития алгоритмов сегментации объектов. По результатам проведённого анализа можно сделать следующие выводы.

1. Большинство объектов на гистологических препаратах представлены слабоконтрастными изображениями и характеризуются большой вариабельностью геометрических и оптических характеристик, в связи с чем при анализе подобных изображений возникают определенные трудности. Поэтому для выбора эффективных методов сегментации требуется дополнительная классификация этих объектов.

2. Автоматический анализ изображений гистологических объектов слабо освещён в литературе.

3. Гистологические объекты характеризуются слабой контрастностью, широким спектром форм и размеров. Поэтому их специфика вносит определенные особенности на этапе сегментации.

4. Можно определить три основных класса методов сегментации объектов на гистологических изображениях: пороговые, морфологические, методы наращивания областей. Хотя существует ещё ряд частных методов сегментации, не относящихся к ним.

5. Тема сегментации медицинских изображений в настоящее время является актуальной и очень важна в диагностических и научных исследованиях.

На основе результатов анализа выдвигается гипотеза: для каждого класса объектов можно определить алгоритм сегментации, позволяющий получить результат, удовлетворяющий исследователей гистологических препаратов.

Вторая глава посвящена сегментации гистологических объектов на полутоновых изображениях.

Глава начинается с классификации гистологических объектов для определения наиболее эффективного метода сегментации. В ходе классификации определяются три основных класса объектов: площадные (клетки, ядра клеток, сосуды и волокна в поперечном срезе), протяженные объекты (сосуды и волокна в продольном срезе), мелкие контрастные объекты (ядрышки, клеточные включения, артефакты) (табл. 1).

Таблица 1

Таблица классификации гистологических объектов и методов их сегментации для каждого класса

Вид объекта

Характеристика

изображения

Равномерный фон

Неравномерный фон

Площадные

Отдельно лежащие объекты одного типа

Пороговая сегментация  

Методы математической морфологии

Объекты

Объекты, сопровождаемые объектами другого типа

Пороговая сегментация

Методы объединения областей

Протяженные объекты

Произвольное изображение

Пороговая сегментация

Морфологическая сегментация, основанная на утоньшении

Мелкие контрастные объекты

Произвольное изображение

Пороговая сегментация

Пороговая сегментация


Страница: