Специальный налоговый режим действует для малого и среднего бизнеса. Существует градация предприятий по уровню доходов и количеству работающих, а также дифференцированная система ставок. С 1 января поправками предусматривается снижение ставок налога в специальном налоговом режиме на основе патента с 3 до 2%, на основе упрощенной декларации вместо раздельной прогрессивной шкалы для индивидуальных предпринимателей со ставками от 3 до 5% и юридических лиц со ставками от 3 до 7% будет введена единая ставка на уровне 3%. По мнению правительства и части депутатов, особо ратовавших за введение данных поправок, «эта мера окажет поддержку инициативной части населения, стремящейся реализовать свои предпринимательские способности и идеи. Малый бизнес станет питательной средой для появления новых высокотехнологичных производств и предприятий обрабатывающего сектора». Правда, несмотря на все преференции последних лет, сумма налоговых поступлений от субъектов МСБ в абсолютном исчислении практически не изменилась, а доля в доходах бюджета даже чуть уменьшилась [17, с.29].

Специальные налоговые режимы предусматриваются также для крестьянских (фермерских) хозяйств, производителей сельскохозяйственной продукции (юридических лиц), отдельных видов предпринимательской деятельности. Наибольшее распространение у крестьянских (фермерских) хозяйств получила работа по патентам.

С 1 января вводится также новый порядок налогообложения дивидендов, с целью избежание двойного налогообложения. Дивиденды, получаемые гражданами Казахстана от иностранных компаний, будут облагаться согласно законам тех стран, в которых они зарегистрированы. Дивиденды, уплачиваемые казахстанскими компаниями, будут облагаться по ставке 15% для иностранных корпоративных клиентов, 10% – для казахстанских юридических и 5% – для физических лиц.

В первую очередь эта мера приведет к повышению инвестиционной привлекательности долевого участия в компаниях, долгосрочных вложений, что означает повышение финансовой устойчивости предприятий и приток инвестиций. Ликвидация двойного налогообложения позволит применять прозрачные схемы участия. Данная мера позволит также активизировать фондовый рынок.

В сфере налогообложения недропользователей Казахстан постепенно перешел на принципы, принятые в странах с рыночной экономикой. 30 мая 1992 года был принят Кодекс РК «О недрах и переработки минерального сырья», который впервые установил договорные принципы предоставления права недропользования. И разведку, и добычу нефти (газа) на территории РК производят на основе соглашений о разделе продукции (СРП). При этом СРП предусматривает такое положение, когда компания - инвестор является подрядчиком владельца прав на недра, которым выступает государство или национальная компания. В тоже время компания получает права собственности на долю добытой продукции, эквивалентную ее затратам и рискам. Государство в этом случае имеет возможность контролировать как сами работы в рамках проекта, так и отношения собственности, связанные с добычей .

С 1 января 2004 года введены изменения, позволяющие максимально упростить методику исчисления специальных платежей недропользователей, уйти от практики договорного установления их размеров в контрактах; обеспечить максимальную транспарентность механизма налогообложения нефтяных операций и гарантированный объем поступлений в бюджет с момента начала добычи нефти на месторождениях с учетом роста мировых цен. В иной редакции изложена статья налогового кодекса по налогу на сверхприбыль. В связи с этим разработаны электронная модель расчета налога на сверхприбыль и инструктивное руководство по его применению, что положительно повлияло на объем поступлений данного вида налога. Так за 2004г. сумма поступления налога на сверхприбыль составила 10 млрд. тенге против 500 млн. тенге в 2003 г. Кроме того, новшеством является то, что плательщиками ренты стали не только недропользователи, но и юридические и физические лица, экспортирующие сырую нефть и газовый конденсат, при этом установлена прогрессивная шкала ставок взимания роялти в зависимости от объема накопленной добычи нефти и газа от 2 до 6 долларов за тонну. Чтобы усовершенствовать методику исчисления рентного налога, разработан порядок определения рыночной цены реализуемой сырой нефти и газового конденсата. Также внесены изменения в раздел о Соглашении по разделу продукции, касающиеся только новых нефтяных контактов, и введен рентный налог с прогрессивной шкалой ставок в зависимости от цены углеводородного сырья на внешних рынках. Деятельность по проведению операций по недропользованию, включая нефтяные операции, подлежит налогообложению в порядке, установленном Налоговым Кодексом. Глава 45 регулирует особенности налогообложения деятельности по проведению операций по недропользованию, включая нефтяные операции и работы по строительству и эксплуатации подземных сооружений, не связанных с добычей, и устанавливает порядок исчисления и уплаты налогов и специальных платежей недропользователей: налога на сверхприбыль; специальных платежей недропользователей:

а) бонусное (подписного, коммерческого обнаружения);

б) роялти;

в) доли Республики Казахстан по разделу продукции;

г) дополнительного платежа недропользователя, осуществляющего деятельность по контракту о разделе продукции.

Недропользователи, осуществляющие добычу полезных ископаемых до заключения контракта на недропользование, производят отчисления за пользование недрами в доход республиканского бюджета в виде роялти в размерах, устанавливаемых Правительством Республики Казахстан. Таким образом, совершенствование системы налогообложения недропользователей позволило значительно увеличить доходы государственного бюджета.

В Республике Казахстан Указом президента РК за № 402 от 23 августа 2003 года был создан Национальный фонд Республики Казахстан целях обеспечения стабильного социально-экономического развитии страны, накопления финансовых средств для будущих поколений, снижения зависимости экономики от воздействия неблагоприятных внешних факторов. Позднее (2004г.) в Бюджетном Кодексе Республики Казахстан в главе 5 дана более подробная характеристика Национального фонда РК, который наполняется за счет средств, поступающих от экспортов нефти, а также сверхплановых поступлений от продажи пакетов акций крупных государственных предприятий, работающих в стратегических отраслях экономики.

Согласно статье 22 Бюджетного Кодекса РК Фонд формируется за счет следующих поступлений:

1) поступлений в Национальный фонд Республики Казахстан;

2) инвестиционных доходов от управления Национальным фондом Республики Казахстан;

3) иных поступлений и доходов, не запрещенных законодательством Республики Казахстан.

Поступления в Национальный фонд Республики Казахстан состоят из:

1) прямых налогов от организаций нефтяного сектора (за исключением налогов, зачисляемых в местные бюджеты), к которым относятся:

корпоративный подоходный налог, налог на сверхприбыль;

налог на добычу полезных ископаемых, бонусы, доля по разделу продукции;