Признав теперь свою ошибку, Троцкий стал помогать Ленину в его борьбе против «левых коммунистов». Но дальнейшее пребывание его на посту народного комиссара по иностранным делам в этой ситуации было невозможным. После переезда Советского правительства в Москву 13 марта 1918 года Троцкого назначают единоличным комиссаром по военным и морским делам взамен существовавшей там коллегии.

Эти дни были для Троцкого временем самокритичных раздумий, осознание своего просчета. Вместе с тем именно в ходе брестской эпопеи Троцкий смог убедиться в превосходстве аналитического ума Ленина, признал его первенство над собой. Об этом он открыто заявил 3 октября 1918 года в одном из выступлений.

Перемещение Троцкого на новый пост было не «ссылкой», а выдвиженим. Декрет от 15 (28) января 1918 года провозглашал добровольческий принцип создания Красной Армии.

Назначение Троцкого на высший военный пост исходило от Ленина и было поддержано Я.М. Свердловым по партийной и советской линиям.

«Был ли я подготовлен для военной работы? - задаваясь вопросом Троцкий в автобиографии. – Разумеется, нет. Мне не довелось даже служить в свое время в царской армии. Призывные годы прошли для меня в тюрьме, ссылке и эмиграции. В 1906 году суд лишил меня гражданских и военных прав. Я не считал себя ни в малейшей степени стратегом и без всякого снисхождения относился к вызванному революцией в партии разливу стратегического дипломатизма. Правда, в трех случаях в войне с Деникиным , в защите Петрограда, и войне с Пилсудским – я занимал самостоятельную стратегическую позицию и боролся за нее то против командования, то против большинства ЦК. Но в этих случаях стратегическая позиция моя определялась политическим и хозяйственным, а не чисто стратегическим углом зрения. Нужно, впрочем, сказать, что вопросы большой стратегии и не могут иначе решаться». Но до вопросов «большой стратегии» было еще далеко. Троцкому приходилось в это время туго. Он учился на ходу, усваивал десятки новых понятий и сведений в день, вникал во все новые и новые тонкости организации армии и ее снабжении. 4 марта 1918 года, по его предложению, Совнарком создает Высший Совет Народной Обороны и Высший Военный Совет. Троцкий становится его председателем, подбирает кадры. Своим заместителем по наркомату Троцкий делает двадцатилетнего военного врача Э.М. Склянского. На долгие годы он будет его главным помощником по всем военным делам. Когда Троцкого назначают 6 сентября 1918 года председателем Революционного Военного Совета республики (РВСР), Склянский становится его заместителем вплоть до 1924 года.

Троцкий принимает участие в разработке проведении в жизнь всех важнейших декретов по военному ведомству в период март-июль 1918 года. Так, 8 апреля 1918 года Совнарком принимает декрет об учреждении волостных, уездных, губернских и окружных комиссариатов по военным делам. Система эта существует до настоящего времени. Тогда же создается Всероссийское бюро военных комиссаров, 8 мая вместо Всероссийской коллегии по формированию Красной Армии был создан Всероссийский главный штаб. Усилиями всех этих органов к 20 апреля число красноармейцев и командиров было доведено до 196 тысяч. 22 апреля 1918 года вводится всеобщее воинское обучение граждан. Идея привлечения военных специалистов, как и старых буржуазных специалистов в народной хозяйство, одновременно выдвигалось и обосновывалось В.И. Лениным и Л.Д.Троцким. V Всероссийский съезд принял 10 июля постановление «Об организации Красной Армии». Это постановление вводило вновь всеобщую воинскую повинность трудящихся с 18 до 40 лет.

Л.Д. Троцкий быстро понял значение внешних стимулов, наград и отличий для такой специфической среды , как военнослужащие. В декабре 1917 года на волне общедемократического движения в армии были упразднены все воинские звания, знаки различия, ордена и медали. В апреле 1918 года Троцкий издает приказ о введении нового отличия Красной Армии – красной звезды на головном уборе вместо «романовской» кокарды. В августе 1918 года Троцкий впервые предлагает ввести и орден «Красному воину» или «Воину-интернационалисту». В дальнейшей разработке эта идея привела к учреждению первого советского ордена Красного Знамени. Троцкий как политический командир все Красной Армии, как революционный военный министр еще не проявил себя в марте-июле 1918 года. Громкая слава, успехи и поражения, восторг сподвижников и интриги врагов ждали его в недалеком будущем, начавшемся с августа 1918 года.

«Современная литература о разногласиях Ленина и Троцкого перегружена апокрифами. Бывали , конечно, и разногласия. Но неизмеримо чаще бывало так, что мы приходили к одному и тому же выводу, обменявшись двумя словами по телефону или независимо друг от друга».

Слова Троцкого о Ленине не случайны в его воспоминаниях. Уважение к Ленину, признание его исключительности и гениальности пронизывают все мемуары Троцкого. Они отражают действительный факт: Троцкий стал близким к Ленину членом правительства и ЦК. Их сотрудничество крепло, и отдельные разногласия лишь оттеняли сотрудничество по большинству вопросов. Но свое место второго человека в партии и государстве Троцкий еще должен был завоевать . Троцкий и Сталин родились в один год (1879), с разнице в два месяца.

В 20-ые годы занимали важнейшие партийные и государственные посты. Обоими свойствен был эгоизм, чрезмерное самомнение. Оба были дважды женаты, у каждого трагическая кончина двух сыновей.

Сталин и Троцкий после смерти Ленина способствовали усилению внутрипартийной борьбы, переросшей в войну не на жизнь, а на смерть.

В годы гражданской войны Троцкий по популярности не уступал Ленину. У Троцкого характер сложный, противоречивый, взрывчатый. Отличался выразительной внешностью: густая копна волос, голубые глаза, орлиный нос.

Сталин отличался однозначностью суждений, упрямством, волей к достижению цели, мстительностью. Внешность невыразительная, но по-своему запоминающаяся: невысокий лоб, лицо изрыто оспой.

Внутрипартийная борьба 1923-1924 гг. Была не только продолжением дискуссии, начатой на X съезде партии. Она являлась драмой , в которой переплетались поиск путей построения социализма и личное соперничество. Поводом к дискуссии послужило письмо Троцкого от 8 октября 1923 года членам ЦК и ЦИК: « . Бюрократизация партийного аппарата достигла неслыханного развития . Теперь нет и в помине . откровенного обмена мнений по вопросам, действительно волнующим партию».

«Тот режим, - указывал он , - который в основном сложился уже до XII съезда, гораздо дальше от рабочей демократии, чем режим жестких периодов «военного коммунизма». А в знаменитом письме под названием «Новый курс» 8 декабря 1923 года Троцкий писал, что первой жертвой бюрократизма становится молодежь. Статья призывала молодых коммунистов не к простому повторению формул, а к борьбе за свое мнение. «Старым курсом» Троцкий называет жизнь партии «на два этажа»: в верхнем – решают, в нижнем – узнают о решениях.

В ходе дискуссии Троцкий и его сторонники начали терпеть одно поражение за другим. Зиновьев и Каменев потребовали исключения Троцкого из партии.