Принятие нереального бюджета было основной проблемой тех лет. По сути, нереальный бюджет - это основа порождения кредиторской задолженности, которая провоцирует, в свою очередь, цепь неплатежей, а их объемы были огромными.

Кроме того, существовала проблема, так называемых, специальных счетов. Государственные организации в этом случае выступали одновременно как коммерческие структуры, конкурируя с частным сектором, при огромных базовых преимуществах. При наличии спецсчетов размывался вопрос эффективного планирования: при утверждении одной суммы, на практике, за счет специальных счетов, государственные органы получали дополнительные доходы и, таким образом, были ориентированы на коммерческую деятельность, а не на выполнение своих основных функций.

Опорными моментами проводимых реформ были определение статуса государственных учреждений, четкое разделение бюджетной сферы и конкурентного сектора, ликвидация специальных счетов, обязательная регистрация всех договоров в Казначействе - в противном случае кредиторская задолженность учреждения не должна была признаваться обязательством государства.

Также были ликвидированы все существовавшие внебюджетные фонды.

В этот период встал вопрос о значительной дифференциации административных расходов в министерствах, ведомствах и регионах.

Считалось, что административные расходы на каждый государственный орган не должны зависеть от «пробивной» силы того или иного руководителя, а должна быть разработана четкая методика: численность, умноженная на норматив. В противном случае, из года в год растет доля административных расходов в составе государственного бюджета.

В наследство от бывшего СССР Казахстану достались многочисленные льготы, огромная категория льготополучателей. Все это было регламентировано более чем в 30 законодательных актах, которые очень трудно понять рядовому человеку, в них разбирались только отдельные специалисты.

Кроме того, льготы не были адресными, и все это создавало трудности при бюджетном планировании. Поскольку социальный блок занимал в расходах государственного бюджета значительную часть, предстояло упорядочить бюджетный процесс.

Все эти проблемы решались путем проведения глубокого анализа бюджетного процесса, разработки методологической базы планирования, изменения нормативных актов.

Так, в 1999 году началась работа по совершенствованию нормативной правовой базы в области целевого и эффективного расходования бюджетных денег, предотвращению роста кредиторской задолженности бюджета путем создания надежных механизмов предварительного контроля за ее образованием.

Введена норма обязательности регистрации в органах казначейства гражданско-правовых сделок за счет бюджетных денег. Некоторые государственные функции были переданы в конкурентную среду и выполнялись в форме оказания услуг государству. Были введены новые принципы межбюджетных отношений. Упразднены все внебюджетные фонды, а их доходы и расходы были консолидированы в государственный бюджет.

Законодательно было закреплено, что все государственные учреждения не вправе брать на себя финансовые обязательства сверх сумм бюджетных назначений, установленных бюджетным законодательством на соответствующий финансовый год.

Значительное внимание в последние годы уделялось контролю за целевым использованием бюджетных средств государственными учреждениями, средств, выделяемых из бюджета на выполнение государственного заказа, целевым использованием и возвратом заемщиками государственных внешних займов, негосударственных займов, привлеченных под гарантии Правительства Республики Казахстан, и бюджетных кредитов.

Приняты меры по обеспечению полноты и своевременности отчислений доли прибыли государственными предприятиями в соответствующие бюджеты, начисления дохода на государственные доли в хозяйственных товариществах и дивидендов на государственные пакеты акций акционерных обществ.

Одной из важных мер по повышению бюджетной дисциплины государственных организаций стали разработка и внедрение в 1996-1998 годах законодательства о государственных закупках, основанного на принципах прозрачности этих процессов, эффективности в выборе поставщиков товаров, работ и услуг, а также обеспечения равных прав.

Тем не менее, в бюджетной системе не были отрегулированы отдельные вопросы. К примеру, это:

первое, механизмы увязки планирования бюджетных средств с их расходованием;

второе, целенаправленность бюджетных расходов;

третье, установление контроля эффективной реализации бюджетных программ;

четвертое, повышение ответственности администраторов за реализацию бюджетных программ;

пятое, механизмы отслеживания возникновения кредиторской задолженности государственных учреждений.

В этой связи, настоящее время Министерством финансов продолжается работа по совершенствованию бюджетной системы, которая на сегодняшний день имеем следующие результаты:

1. Достигнуто формирование программного, целенаправленного бюджета, отражающего приоритеты социально-экономического развития страны путем разделения бюджетных программ на текущие бюджетные программы и бюджетные программы развития.

Бюджет разделен на текущий бюджет, за счет которого будут осуществляться программы, направленные на выполнение текущих нужд государства, и бюджет развития, включающий расходы на инвестиции в экономику, в том числе на инфраструктуру, градостроительство, информатизацию государственных учреждений, науку, подготовку кадров.

Такое разделение бюджета позволит также реально оценивать стоимость выполнения государством своих функций, определенных законодательством и направленных на содержание имеющейся сети государственных учреждений, и объем инвестиционного вклада государства на его социально-экономическое развитие, а также систематизировать бюджетные программы.

2. В целях взаимоувязки инвестиционной политики государства и бюджетной политики установлены требования, которым должны соответствовать инвестиционные проекты, и порядок их включения в бюджет.

Инвестиционные проекты, предлагаемые к финансированию из республиканского или местного бюджета, должны соответствовать приоритетам социально-экономического развития страны, отраженным в индикативном плане развития республики или отдельного региона, при этом необходимо наличие технико-экономического обоснования, проектно-сметной документации, положительного заключения отраслевого уполномоченного органа, исполнительного органа по экономическому планированию.

Инвестиционные проекты, предлагаемые к финансированию из республиканского или местного бюджета, будут рассматриваться соответствующей бюджетной комиссией.

3. С 2002 года введен паспорт бюджетной программы как основной документ оценки деятельности администратора по выполнению возложенных на него функций. Паспорта утверждаются Правительством и местными исполнительными органами и определяют стоимость бюджетной программы, нормативно-правовую основу, источник финансирования, цель, задачи, мероприятия по реализации программ, ожидаемые результаты реализации данной программы, ответственных исполнителей, сроки реализации программы.