Учитывая изложенное, а также то, что лицо, совершающее операции с нефтепродуктами и аннулировавшее свидетельство до окончания налогового периода, является налогоплательщиком акциза за период до момента его аннулирования и соответственно представляет за этот период налоговую декларацию, в случае представления этим лицом в момент отсутствия у него свидетельства реестра счетов-фактур по нефтепродуктам, приобретение которых в период действия свидетельства отражено в указанной декларации, проставление отметки на этих реестрах правомерно.

Налоговые вычеты производятся на основании расчетных документов и счетов-фактур, выставленных продавцами при приобретении налогоплательщиком подакцизных товаров, либо предъявленных налогоплательщиком собственнику давальческого сырья (материалов) при его производстве, либо на основании таможенных деклараций или иных документов, подтверждающих ввоз подакцизных товаров на таможенную территорию Российской Федерации и уплату соответствующей суммы акциза.

В случае оплаты подакцизных товаров, использованных в качестве сырья для производства других товаров, третьими лицами, вычеты производятся, если в расчетных документах указано наименование организации, за которую произведена оплата.

Если в качестве давальческого сырья использовались подакцизные товары, по которым на территории Российской Федерации уже был уплачен акциз, вычеты осуществляются при представлении налогоплательщиками копий платежных документов с отметкой банка, подтверждающих факт уплаты акциза владельцем сырья (материалов) либо факт оплаты владельцем стоимости сырья по ценам, включающим акциз.

Для подтверждения права на вычет акциза, уплаченного при ввозе на таможенную территорию Российской Федерации, налогоплательщик представляет в налоговый орган следующие документы:

1) контракт (его копию) на приобретение импортируемых нефтепродуктов;

2) грузовую таможенную декларацию (ее копию);

3) платежные документы, подтверждающие факт оплаты акциза при выпуске в свободное обращение на территории Российской Федерации ввезенных нефтепродуктов.

Вычет сумм акциза, уплаченных при ввозе на таможенную территорию Российской Федерации, производится после оприходования ввезенных подакцизных нефтепродуктов.

Если сумма налоговых вычетов в каком-либо налоговом периоде превышает сумму акциза, исчисленную по реализованным подакцизным товарам, налогоплательщик в этом налоговом периоде акциз не уплачивает. Сумма превышения налоговых вычетов над суммой акциза, исчисленной по операциям, признаваемым объектом налогообложения, подлежит зачету в счет текущих и (или) предстоящих в следующем налоговом периоде платежей по акцизу. Сумма превышения налоговых вычетов над суммой акциза, исчисленной по операциям, признаваемым объектом налогообложения и совершенным в отчетном налоговом периоде, подлежит вычету из общей суммы акциза в следующем налоговом периоде в первоочередном по сравнению с другими налоговыми вычетами порядке.

Таким образом, сумма превышения акциза, предъявленная продавцом и уплаченная налогоплательщиком при приобретении подакцизных товаров, над суммой акциза, исчисленной в текущем налоговом периоде по операциям, признаваемым объектом налогообложения акцизами, подлежит зачету в счет текущих и (или) предстоящих в следующем налоговом периоде платежей по акцизу.

У индивидуальных предпринимателей - плательщиков акцизов суммы налога должны включаться в расходы при определении налоговой базы по налогу на доходы физических лиц. По мнению С.М. Рюмина, учитывая механизм расчета сумм акцизов, реально подлежащих уплате в бюджет (начисленные суммы налога за минусом налогового вычета), порядок учета таких сумм предпринимателями должен быть аналогичен порядку по НДС, поскольку порядок уплаты НДС имеет очень схожий механизм взимания.