Возбужденное ликование чехов и повсеместное посрамление германофилов сказались на обстановке в Карловом университете естественным для монархического государства образом: австрийский министр Бах приструнил студиозусов-патриотов, отменил намеченные было демократические послабления в университетском уставе, кое-кого из учащихся и профессоров и вовсе выставил вон. Но страхи миновали, империя жила, последний Габсбург, отметившийся архитектурными изысками не только в Вене и Будапеште, но и в Праге, в сущности, был либералом, а неудачливый Рудольф, закончивший дни в Майерлинге, благоволил чешской гуманитарной мысли, поскольку воспитывался именно чешскими философами-либералами. Великолепный театр Рудольфинум, построенный Шульцем как раз к 1884 году, до сих пор напоминает о несчастном Руди. А за два года до этого венские бюрократы наконец разделили Карлов университет на два отделения - немецкое и чешское, и впервые за всю историю Карлова чешская речь зазвучала в аудиториях. Между прочим, чехи не были мстительны, и когда в 1918 провозгласили независимость Чехословакии, сохранили в своем старейшем и знаменитейшем университете немецкую составляющую.

Золотые двадцатилетие Чехословакии - от обретения независимости до позорной немецкой оккупации, превратившей одну из самых многообещающих и культурных стран послевоенной Европы в "протекторат Богемию и Моравию", - было поистине счастливейшим периодом в истории Карлова. Чешские политические лидеры Томаш Масарик, Эдвард Бенеш были выпускниками педагогического факультета Карлова. Они же, помимо общественной деятельности, занимались и серьезными филологическими изысканиями, были членами знаменитого на весь мир Пражского лингвистического кружка, куда входили и выдающиеся филологи, эмигрировавшие из России. Русские, естественно, не только лингвисты, существенно обогатили знаменитую университетскую библиотеку Климентинум, во многом именно их усилиями сформировался фонд Славянской библиотеки, переведенной в Климентинум в 1929 году.

Черный год Карлова - 1939. Фашисты закрыли чешские вузы, естественно, Карлов был закрыт для чехов. Студентов и профессоров оправляли прямым ходом в концентрационные лагеря. Немецкая часть была торжественно провозглашена рейхсуниверситетом. И в этом качестве закрыта в 1945 году. Но на нормальную жизнь вернувшимся выжившим профессорам и вновь набранным студентам было отпущено всего три года. Дальше начались чистки, трагикомические десанты красной профессуры из СССР, долженствующие поднять на достойный уровень чешскую философию и филологию. Несмотря на это, в 1968 году карловцы были главными пражскими бунтарями. Все кто не уехал, не убежал, не ушел до майских событий, были отлучены от университета после них. Это печальное двадцатилетие способствовало тому, что традиционно сильная гуманитарная составляющая в Карлове оказалась ослабленной, а вот естественные и точные науки пострадали несколько меньше. Сейчас университет старается восстановить свою репутацию по всем учебным направлениям. Многочисленные факультеты расположены не только в Праге, но и, например, в Пльзене. Структура вуза сложна и охватывает все мыслимые отрасли современного высшего образования.