Самые крупные реки республики (и всей Средней Азии) — Амударья и Сырдарья. Они, как и их притоки, берут начало вне пределов Узбекистана. Амуда­рья в пределах Узбекистана оказывается средней и нижней частью своего течения. Длина ее (вместе с Пянджем) — 2540км. Из притоков Амударьи по территории Узбекистана проте­кают Сурхандарья, Шерабад, Кашкадарья и Зеравшан (последний не доходит до Амударьи: его воды целиком разбира­ются на орошение).

Сырдарья — вторая по водоносности река в Средней Азии. На территорию рес­публики приходится ее среднее тече­ние. Длина реки (с Нарыном) — 3019 км, площадь бассейна — 462 тыс. кв. км. Самый крупный приток Сырдарьи в пре­делах Узбекистана — р. Чирчик.

Реки Узбекистана, кроме Амударьи и Сырдарьи, не очень мутны. Только у Сурхандарьи и Шерабада при выходе с гор воды несут 3 кг взвесей на 1 куб. м. Среднегодовая мутность большинства постоянных водотоков составляет 200— 500 г/м3.

Равнины Узбекистана не участвуют в формировании поверхностного стока, но зато активно его потребляют. Здесь интенсивно разбирается на орошение вода, поступающая с гор. Уже в предгор­ной части республики часть речных вод отводят каналами на поля. С 1961 г. из-за хозяйственной деятельности приток вод в Аральское море систематически умень­шался. До 20% этих вод пошло на заполнение Сарыкамышской и Арнасайской впадин. Поэтому Узбеки­стан испытывает недостаток в поливных водах, в связи с чем возрастает интерес к проектам переброски части стока си­бирских рек на юг, в Среднюю Азию.

Озера на территории Узбекистана ма­лочисленны, невелики и распростране­ны неравномерно, преимущественно в го­рах. На равнинах встречаются озера и во­дохранилища на сбросах ирригационных систем (Судочье, Арнасай, Чардаринское, Чарвакское и др.). По размерам и объему накопленной в них воды водохра­нилища во много раз превосходят есте­ственные озера. Освоение новых площа­дей под хлопководство стимулирует рас­ширение сети водохранилищ.

Крупнейшее в Средней Азии озеро — Аральское море (площадь 66 тыс. кв. км) входит в пределы Узбекистана южной своей частью. Аральское море - второй по величине после Каспия бессточный водоем на Земле . Арал не связан с океаном и поэтому является не морем, а озером . Морем его называют благодаря огромным размерам и режиму, сходному с морским .

Совсем недавно Аральское море славилось рыбными запасами . Дельты рек Амударьи и Сырдарьи были своеобразными зелеными оазисами среди пустыни . Природные богатства дельт составляли густые заросли тростника, тугайные леса, озера, богатые рыбой, водоплавающей птицей и ондатрой, сенокосные угодья, пастбища и орошаемые земли .

В первой половине XX века режим Аральского моря был довольно устойчив . Водоем получал регулярное питание водой впадающих в него Амударьи и Сырдарьи . Уровень моря был почти стабилен .Но за последние десятилетия в природе Арала и условиях жизни населения на его берегах произошли катастрофические изменения . С 1961 года уровень Арала начал быстро падать и водоем стал усыхать. При жизни практически одного поколения произошла крупнейшая на Земле экологическая катастрофа.

Непосредственная физическая причина снижения уровня Аральского моря - это нарушение водного баланса водоема превышение расхода воды над приходом . Большая часть высохшего бывшего дна Аральского моря превратилась в солончаки, которые постепенно осваиваются растительностью, характерной для солончаковых пустынь . Вблизи прежних берегов моря возникли эоловые формы рельефа . Дельты Амударьи и Сырдарьи практически полностью высохли, утратив уникальные природные особенности .

Узбекистан обладает и подземными водными ресурсами (общий расход — 120 куб. м/с). Подземные воды широко применяются в водоснабжении, ороше­нии, обводнении пастбищ. В горах рас­пространены трещинные и трещинно-Карстовые грунтовые воды, на равнинах артезианские бассейны. Узбекистан богат целебными минеральными водами.В республике выявлены сероводородные, йодоносные, радоновые и слабоминера­лизованные щелочные термальные воды. Сероводородные источники Ферганского и Сурхандарьинского бассейнов по своим качествам не уступают широко извест­ным водам Мацесты.

Животный и растительный мир:

Флора Узбекистана насчитывает около 3700 видов высших растений. Гене­тически она связана с флорой Средизем­номорья и Юго-Западной Азии. Не ме­нее 20% видов — эндемики, т. е. больше нигде не встречаются: большая часть их произрастает в горах. Во флоре множе­ство дубильных, пищевых, лекарствен­ных, технических и просто декоративных растений, рациональное использование которых приобретает плановый харак­тер.

Почти вся территория республики за­нята пустынями. По характеру грунтов различают каменистые, песчаные, глини­стые, лёссовые и солончаковые пустыни.

В каменистых и глинистых пустынях рас­тут полыни (серозёмная, черная, узко-дольчатая и др.), прутняк, солянки, места­ми — травы-эфемеры. На засоленных массивах господствуют различные (в том числе и кустарниковые) солянки, биюргун тургайский, белая полынь и дру­гие солевыносливые растения (галофиты). В пустынях с лёссовыми грун­тами преобладают эфемеровые травостои (осока, мятлик, маки, ферула, дорема и др.), выгорающие с началом летней жары. Во всех этих вариантах пустынь доля эфемеров в растительном покрове нарастает к югу, где лучше выражен максимум осадков в холодное время года (средиземноморский режим).

Растительность песчаных пустынь раз­нообразна. Здесь встречаются деревья, кустарники, полукустарники, геофиты (луковичные и клубневые растения), мно­голетние и однолетние травы. Разрежен­ный растительный покров песчаных пу­стынь формируют травы-псаммофиты (т. е. приспособленные к жизни в сыпучих песках). Среди них выделяются злак селин (аристида), кустарниковый жузгун (каллигонум), древесные и кустарнико­вые саксаулы (белый и черный), полуку­старниковые полыни (белая, туранская и др.). Встречаются и незакрепленные пе­ски, лишенные растительности, но их сравнительно немного.

Растения пустынь хорошо приспособле­ны к длительной засухе, перегреву, под­вижным или засоленным и всегда бедным грунтам. Широко распространены та­кие приспособления, как безлистность, уменьшающая испарение (саксаулы, жуз­гун и др.), быстрое укоренение, уход в «спячку» во время жары (луковичные и клубневые растения).

В полном соответствии с экологическими особенностями пустынь сформиро­валась и их фауна. Здесь обитают быстро­ногие млекопитающие, способные пере­бегать на большие расстояния в поисках воды и пищи (джейран, сайгак), многочи­сленные грызуны, довольствующиеся ми­нимумом воды (суслик, тушканчик, по­левка, песчанка, землеройка, слепушонок и др.), змеи, часто ядовитые (эфа, кобра), ящерицы (варан, круглоголовка, агама, геккон и др.), черепахи.

Совсем иной состав фауны во влажных пойменных (тугайных) зарослях. Там жи­вут камышовый кот, кабан, шакал, заяц, фазан и др. В оазисах множество жаб, ящериц (геккон, гологлаз) и птиц (гор­линка, воробей, ласточка, туркестанский скворец, скворец-майна, черный дрозд).