Алма-Атинский - заповедник площадью 89.5 тысяч га. расположен в бассейне рек Танар и Иссык в центральной части Заилийского Алатау. К этому же заповеднику относится пустынный участок долины реки Или с интереснейшим природным объектом - песчанными барханами "Поющие пески".

Природа горной части заповедника очень живописна. На склонах хребта Заилийского Алатау хорошо выраженны ландшафты предгорных степей, лесо-луговостепного, субальпийского и альпийского поясов. Большой интерес вызывает горный узел Талгара высотой 5087 м. Разнообразна фауна и флора заповедника: заросли дикой яблони, абрикоса, боярышника сменяются хвойными лесами из тянь-шаньской ели. С высоты 2800 м. над уровнем моря начинаются горные луга, на границе леса и субальпийских лугов широко распространены заросли арчи Тургайской. Водораздельная часть хребта Заилийского Алатау занята ландшафтами ледниково-снеговых высокогорий. Здесь много крупных ледников, снежников и суровых скал. животный мир насчитывает 39 видов млекопитающих. В их числе сибирские козлы, архары, косули, маралы. Из хищников обычны тянь-шаньские бурые медведи, волки, лисы, куницы, иногда можно встретить снежного барса. Из 117 видов птиц заповедника наиболее характерны беркуты, горные индейки-улары, иволги, дрозды, лазаревки, кедровки, дятлы, совы, тетерева, кеклики, вьюрки, горихвостки. В пустынной части заповедника, в долине реки Или преобладают ландшафты с однообразной полынно-солянновой растительностью. Между горами Колкон расположен знаменитый "Поющий бархан" высотой около 150 м., издающий сильный звук при движении по его песчаным склонам. Характерными представителями являются джейраны, в тугаях долины реки Или встречаются фазаны, обычные рябки, многочисленные ящерицы. В заповеднике ведется большая работа по выявлению взаимоотношений организмов в высокогорных и пустынных условиях. Наибольший интерес представляют опыты по акклиматизации на Тянь-Шане зубров и других животных и по восстановлению ценнейших хвойных лесов.

Барсакельмес - заповедник в Кызыл-Ординской области на одноименном острове в Аральском море. Площадь его 18.3 тысячи га. Пустынные ландшафты острова однообразны: преобладают полынно-саляновая и хмеровая растительность, встречаются изреженные заросли саксаульников и курганы на песчаных барханах. Флора острова насчитывает 165 видов растений. Животный мир довольно беден в видовом отношении, но имеет значительную плотность. Здесь обитают 12 видов млекопитающих (кулан, джейран, сайгак, карсак, лиса, волк, суслик-песчанник и другие) 7 видов пресмыкающихся и 202 вида птиц. Сейчас в заповеднике ведутся научные исследования по изучению последствий падения уровня Аральского моря на растительность и животный мир Приаралья.

Кургальджинский заповедник находится в степях Целиноградской области и занимает пресное озеро Кургальджин, часть соленого озера Тэнгиз с примыкающими прибрежными участками, расположенными в низовьях рек Нуры и Кулакутнес. Площадь заповедника 193,5 тысячи га. Он организован в 1968 году в целях сохранения участка зоны Казахстана и редчайших гнездовий птицы - розового фламинго. Преобладающую площадь заповедника (107.7 тысяч га.) занимает поверхность озер Кургальджин и Тэнгиз и заболоченных побережий. Заповедник охватывает так же узкую полосу типчаково-ковыльной степи, примыкающую к озеру Кургальджин, и его побережье с густыми тростниковыми зарослями. Здесь многочисленны гнездовья водоплавающих птиц, особенно гусей и уток, много лебедей. Изредка встречается дрофа обыкновенная, дрофа-красотка и стрепеты - прежде типичные обитатели целинных земель степей Казахстана. Гнездится редкая белая цапля. На озере Тэнгиз находится самое северное в мире гнездовье редчайших птиц розовых фламинго. В тростниковых зарослях встречаются кабаны. Тенгиз-Кургальджинские озера места концентрации огромного количества водоплавающих птиц во время весенних перелетов, благодаря чему Кургальджинский заповедник приобрел мировую известность. Он включен в список ЮНЕСКО, как особо охраняемый ландшафт болотно-озерных угодий.

Наурзумский заповедник находится в Кустанайской области, занимает 85.6 тысяч га. Организован в 1934 году в целях охраны Наурзумского соснового бора - одного из самых южных массивов сосновых лесов в Казахстане, и озер - мест гнездовья водоплавающих птиц. Здесь преобладают ландшафты бугристых песков с сосновым бором Наурзум-Карагай, примыкающих к лесу типчаковых ковыльных степных равнин, солонцово-солончаковых побережий и акваторий озер Сарымойын, Жарколь, Аксуат, Чушколы. В заповеднике встречаются 25 видов млекопитающих, 150 видов птиц. Для местной фауны характерно совместное присутствие как лесных, так и степных видов. К числу наиболее интересных обитателей заповедника относится очень редкая белая цапля. На озерах гнездится множество водоплавающих птиц и таких редких, как серый гусь и красноголовый нырок. На озерах Аксуат, Сарымойын и других летом собирается на линьку огромное количество водоплавающих птиц со всего Северного Казахстана и из Западной Сибири, осенью на кормежку и отдых их собирается сотни тысяч. Научная работа проводимая в Наурзумском заповеднике, направлена на расширение вопросов, связанных с изучением взаимодействия лесной, степной и озерной фауны. Особое место занимают задачи восстановления соснового бора, значительная часть которого была уничтожена пожаром в 1964 году, развития леса в степной зоне.

Маркакольский заповедник расположен в горах южного Алтая, на территории Восточно-Казахстанской области. Площадь его 71.4 тысяча га. В состав заповедника входят горно-степные горно-лесные ландшафты Маркакольской межгорной впадины и окаймляющих ее горных хребтов, а так же значительная часть водной поверхности озера Маркаколь. Основные типы охраняемых ландшафтов - горные склоны Курчумского хребта, озеро Маркаколь с наклонной приозерной равниной, пересеченной несколькими горными речками, самой крупной из которых является река Тополевка. Горы на территории заповедника имеют абсолютные высоты от 1485 м. (озеро Маркаколь) до 3370 м. В горах отчетливо выражены высотные пояса: лугово-степной, горно-таежной, альпийских и субальпийских лугов и ледниково-снеговой. Наибольший интерес вызывает природный комплекс светлохвойной (лиственница-сибирская) и темнохвойной (ель и пихта) тайги на склонах Курчумского хребта. В лесу много кустарников: черемуха, смородина, боярышник, шиповник. Богаты разнотравной злаковой растительностью горные луга. Многие растения имеют лекарственное значение (маралий и золотой корень).

Богат и разнообразен животный мир заповедника. Здесь встречается 39 видов млекопитающих, около 200 видов птиц. Среди них косули бурый медведь, рысь, рассомаха, белка-телеутка, холонок, алтайский улар и многие другие.

Особый интерес вызывает горное озеро Маркаколь тектонического происхождения, лежит оно на высоте 1485 м. над уровнем моря, площадь 544 км2, наибольшая глубина озера 27 м. В озере водится очень редкая рыба сиг-ускуч.

Шесть заповедников на территории Казахстана не охватывают всего разнообразия природных условий. Поэтому целесообразна организация еще нескольких. В первую очередь их следует организовать в долине реки Урал, в низовьях реки Тургай, в лесо-степной зоне Северного Казахстана, в пределах глубочайшей впадины, на территории СНГ, Караше - на Мангышлаке, на плато Устюрт, в Джунгарском Алатау, в горах Саур и Тарбаготай, в низовья Ереминтау и Кент в Центральном Казахстане, в горах Каратау, в песках Кызылкум и в пределах ряда других ландшафтов Казахстана.